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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003564`

染色体: Chr05 坐标: 47595351-47596151 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003564`
名称	SmilChr05G003564
描述	uncharacterized SmilChr05G003564
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47595351 - 47596151 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026039`
GeneID	`131026039`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026039`
原始查询	`LOC131026039`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=26.1; qcov=0.921; evalue=3.5e-20; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=36.6; qcov=0.944; evalue=1.89e-47; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026039

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811798.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811798.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811798.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811798.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811798.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47595404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr5:47595477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:47595505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C48
`Chr5:47595562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:47595566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B41,B68,C48
`Chr5:47595715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B18,C38,C67
`Chr5:47595738`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A13,A24,B47,B71,C62
`Chr5:47595738`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A13,A24,B47,B71,C62
`Chr5:47595761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A10,B108,B24,B68,B71,B85,B87,C44,C48,D6
`Chr5:47595812`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B47
`Chr5:47595812`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B47
`Chr5:47595821`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811798.1

266 aa

133

266

SWIM

PF04434 SWIM 123-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811798.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	123	152	1.8e-11	44.0	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955815.1
ATGGAGGAGATGAAAGCTGAGAGTCAGGAAGCACACACAGATTTTATGAACAGGGAATACCACAGGTTTTGTAGATGCTTTATCTCTACACATTGTCTATCTGATATGGTTGATAATAATGTCTCTGAGACATTTAATGGCTATATAGTGAAAGCTAGGGCTAAGCACATAATCACCATGTTAGAAGACATTAGAGTTACTTTAAGGGGGAGACAGTACAAAAAGCTGGGGTTGGTGACTGATAGTACTGAAAAACTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026039
ATGGAGGAGATGAAAGCTGAGAGTCAGGAAGCACACACAGATTTTATGAACAGGGAATACCACAGGTTTTGTAGATGCTTTATCTCTACACATTGTCTATCTGATATGGTTGATAATAATGTCTCTGAGACATTTAATGGCTATATAGTGAAAGCTAGGGCTAAGCACATAATCACCATGTTAGAAGACATTAGAGTTACTTTAAGGGGGAGACAGTACAAAAAGCTGGGGTTGGTGACTGATAGTACTGAAAAACTATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811798.1
MEEMKAESQEAHTDFMNREYHRFCRCFISTHCLSDMVDNNVSETFNGYIVKARAKHIITMLEDIRVTLRGRQYKKLGLVTDSTEKLCPNIRKKLDKLRYDARICQAYPGLGGKFEVSCYDDRFVVQLGEKHCSCRQWDISGIPCKHAIAALHFMNEEPTEYVHECYSVEKYLKAYAYGLEPINGEKMWPKGVGYPVQPPLIRAMPGRPKKKRRRDVDERDPNNNTRLKRIGIRMTCQNCLQVGHNARSCKNEKVVREEGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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