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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003571`

染色体: Chr05 坐标: 47678449-47679947 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003571`
名称	SmilChr05G003571
描述	uncharacterized SmilChr05G003571
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47678449 - 47679947 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026042`
GeneID	`131026042`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026042`
原始查询	`LOC131026042`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026042

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057811801.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811801.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811801.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811801.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811801.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47678713`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A6,C4
`Chr5:47678713`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A6,C4
`Chr5:47678714`	`TTA`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A6,C4
`Chr5:47678726`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A25,A4,B127,B50,B56,B70,B9,C41,C5,C58,C87,D2
`Chr5:47678983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:47679045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:47679061`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A18,A20,A8,B122,B125,B131,B132,B133,B139,B34,B36,B42,B53,B58,B61,B63,B64,B79,B84,B96,B99,C21,C5,C50,C64,C71,D8
`Chr5:47679083`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A18,C1,C76,D4
`Chr5:47679083`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A18,C1,C76,D4
`Chr5:47679118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	97	A13,A15,A16,A18,A24,A8,A9,B1,B102,B103,B105,B106,B107,B110,B114,B118,B120,B121,B129,B132,B135,B15,B16,B19,B23,B25,B26,B27,B3,B30,B31,B32,B38,B39,B45,B49,B5,B50,B55,B59,B6,B61,B62,B63,B65,B7,B73,B77,B78,B8,B84,B85,B86,B89,B93,B95,B97,C10,C11,C17,C2,C23,C27,C28,C29,C34,C36,C39,C4,C40,C45,C46,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C59,C63,C67,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C81,C84,C85,D1,D5,D8,D9
`Chr5:47679142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:47679177`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	77	A11,A15,A16,A18,A2,A20,A23,A8,B102,B108,B109,B110,B113,B117,B118,B119,B120,B122,B123,B125,B127,B129,B132,B138,B139,B16,B2,B25,B28,B34,B36,B42,B43,B51,B53,B57,B58,B61,B63,B64,B73,B74,B75,B79,B82,B84,B90,B92,B99,C1,C20,C21,C24,C3,C35,C49,C5,C50,C54,C55,C58,C64,C66,C7,C70,C71,C73,C74,C83,C84,D10,D11,D3,D4,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811801.1

375 aa

188

375

FBA_1

PF07734 FBA_1 61-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811801.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	61	267	2.5e-09	37.3	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955818.1
ATGGCTGGGTTTGCTGTTGTTAGTGAAGATGAAAGAAACAAGTATCGTTTATCAGTTATGTGTCCAGTAGAGCTGTCTGTATCTGAAAATTTCAACGTTAATTCCTTTAAAAAGCATGATACAGTTCTTGGTGTCCTTACTCCGCCCAATTTCTTACCCCCTCCAAATGATGGCATTGTGACATATAGTGGTCTGGGCTATGATGCTAAATCTGGAGACTTAAAGGTGATAAGACGATATGTTCAACATTATATACGTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026042
ATGGCTGGGTTTGCTGTTGTTAGTGAAGATGAAAGAAACAAGTATCGTTTATCAGTTATGTGTCCAGTAGAGCTGTCTGTATCTGAAAATTTCAACGTTAATTCCTTTAAAAAGCATGATACAGTTCTTGGTGTCCTTACTCCGCCCAATTTCTTACCCCCTCCAAATGATGGCATTGTGACATATAGTGGTCTGGGCTATGATGCTAAATCTGGAGACTTAAAGGTGATAAGACGATATGTTCAACATTATATACGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811801.1
MAGFAVVSEDERNKYRLSVMCPVELSVSENFNVNSFKKHDTVLGVLTPPNFLPPPNDGIVTYSGLGYDAKSGDLKVIRRYVQHYIRKIDETDGATGYHGCKSHTELYSSKDNEWKKIKHAVGCVAAGVGVSVEETGSCYWVVRVDPSEQKIKEYLERHSITDPSALHVLSFDFATDSFELIPLPATTIRAYFLLCKVRGSIGALAYWKSCSSELCIKAFVLEGTSWGVLCDDIPPLGDVERPLGLKDDRWLFVEAKASDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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