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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003584`

染色体: Chr05 坐标: 47874489-47877729 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003584`
名称	SmilChr05G003584
描述	UPF0496 protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47874489 - 47877729 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026047`
GeneID	`131026047`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026047`
原始查询	`LOC131026047`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0496 protein 1-like
产物	UPF0496 protein 1-like
Arabidopsis	`AT4G34320` (AT4G34320) transmembrane protein, putative (DUF677) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829582] identity=48.5; qcov=0.861; evalue=1.47e-35; confidence=medium
Rice	`Os03g0199100` - identity=51.4; qcov=0.924; evalue=7.26e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05055 (DUF677)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026047

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811806.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811806.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811806.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811806.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811806.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47874519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B88,C22,C23,C59
`Chr5:47874542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:47875189`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B104,B107,B11,B129,B133,B16,B31,B71,B81,C1,C25,C60
`Chr5:47875197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B29
`Chr5:47875210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C76
`Chr5:47875217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B104,B43,B52
`Chr5:47875221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A10,A18,B12,B28,B32,B82,C18,C37,C87
`Chr5:47875261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B3,B45,D11,D7
`Chr5:47875263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A10,A18,A21,B12,B2,B28,B32,B79,B82,C18,C37,C73,C86,C87,D4,D5
`Chr5:47875276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B77,B99,C79
`Chr5:47875282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C60
`Chr5:47875287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	71	A1,A11,A14,A16,A20,A23,A3,A4,A5,A9,B100,B101,B102,B104,B105,B112,B118,B12,B125,B131,B132,B136,B139,B140,B17,B19,B22,B29,B30,B31,B33,B35,B36,B42,B44,B45,B48,B5,B52,B59,B6,B62,B65,B77,B83,B86,B92,B99,C10,C13,C26,C27,C29,C33,C4,C49,C50,C51,C52,C6,C7,C71,C76,C79,C85,C9,D1,D11,D6,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811806.1

158 aa

158

DUF677

PF05055 DUF677 2-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811806.1`	Pfam	`PF05055`	DUF677	Family	2	134	5.2e-34	118.4	Protein of unknown function (DUF677)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955823.1
ATGGAGCGCGACATTTGGAAAGACGACGAATTCTCCGATCTCGTCGTCTTCGAGAATTGCCTCCACACCTTGGATTTCTGCACCGCCCTCGATTCGTGCCTCAAACGCGCCGCGTGCATCGAATCTATCGTCAAAGTCGCCCTCCGCAAATTCGACGACGACCGAGCAAATGCGGGGAGGAATTACTCGAGAACTCTGGCGGAATTGAGGAATTTCAGCGCCGCGGAGGAGCTGTTCACGCAGGAGTTCTTCAAGGTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026047
ATGGAGCGCGACATTTGGAAAGACGACGAATTCTCCGATCTCGTCGTCTTCGAGAATTGCCTCCACACCTTGGATTTCTGCACCGCCCTCGATTCGTGCCTCAAACGCGCCGCGTGCATCGAATCTATCGTCAAAGTCGCCCTCCGCAAATTCGACGACGACCGAGCAAATGCGGGGAGGAATTACTCGAGAACTCTGGCGGAATTGAGGAATTTCAGCGCCGCGGAGGAGCTGTTCACGCAGGAGTTCTTCAAGGTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811806.1
MERDIWKDDEFSDLVVFENCLHTLDFCTALDSCLKRAACIESIVKVALRKFDDDRANAGRNYSRTLAELRNFSAAEELFTQEFFKVFTRVYAKQALMLERLQAKKQNLDIKLGKLQAWRKVSNVIFAVTFAAVLELDGLEMDARRWKKLVKVENYGRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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