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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003588`

染色体: Chr05 坐标: 47950534-47951604 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003588`
名称	SmilChr05G003588
描述	uncharacterized SmilChr05G003588
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47950534 - 47951604 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026048`
GeneID	`131026048`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026048`
原始查询	`LOC131026048`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=45; qcov=0.393; evalue=7.43e-28; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=52.6; qcov=0.801; evalue=3.71e-103; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026048

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811808.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057811808.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811808.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811808.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811808.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47950572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr5:47950596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B74,B77,C2
`Chr5:47950602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B48,B94,C1,C29,C55
`Chr5:47950615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B102,B115,B54,B68,C74
`Chr5:47950615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B115,B54,B68,C74
`Chr5:47950618`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B23,B46
`Chr5:47950618`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B23,B46
`Chr5:47950648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B41
`Chr5:47950648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:47950654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:47950660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr5:47950669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	207	A1,A11,A13,A18,A2,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,B1,B100,B101,B103,B104,B105,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B44,B45,B46,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B59,B60,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C41,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C58,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811808.1

356 aa

178

356

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 66-104 aa PF04827 Plant_tran 174-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811808.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	66	104	1.4e-16	60.7	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057811808.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	174	319	7.9e-74	248.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955825.1
ATGGCCTCCAGTTCTAATATTGGTGCTTCAAATTCTAGCGATGATGAATCATGGGAACAAAGCGTTGCCGAACATAATCGCCAACTTGATCGCATCATTGAGAATGTGGTAATCCAGGCTGCAAGTCTATCTGTACAACCTACCAATCATGCCGTTAGAGCAAGGAGGCGGTATATTGAAAGAAGACGTGAGATAGGTCATGAAGGTGTGTTCGAGCAGTACTTTTCAGAAGATCCAATCTATCCCCCAGAATATTTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026048
ATGGCCTCCAGTTCTAATATTGGTGCTTCAAATTCTAGCGATGATGAATCATGGGAACAAAGCGTTGCCGAACATAATCGCCAACTTGATCGCATCATTGAGAATGTGGTAATCCAGGCTGCAAGTCTATCTGTACAACCTACCAATCATGCCGTTAGAGCAAGGAGGCGGTATATTGAAAGAAGACGTGAGATAGGTCATGAAGGTGTGTTCGAGCAGTACTTTTCAGAAGATCCAATCTATCCCCCAGAATATTTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811808.1
MASSSNIGASNSSDDESWEQSVAEHNRQLDRIIENVVIQAASLSVQPTNHAVRARRRYIERRREIGHEGVFEQYFSEDPIYPPEYFRTRFRMRKPLFERIMNKLVATDRYFQQHPDAAGRLGMSPIQKCTAAMRVLAYGTSADLHDEYLRMSAQVIRKSVIKFVEGVISNFGAEYLRKPTEEDMAALLHIGERRGFPGMMGSIDCMHWEWKNCPTAWAGQYAGRSGTRTIILEAVASQDLWIWHAFFGTPGSRNDINVLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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