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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003590`

染色体: Chr05 坐标: 47994312-47995328 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003590`
名称	SmilChr05G003590
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47994312 - 47995328 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026049`
GeneID	`131026049`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026049`
原始查询	`LOC131026049`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=44.9; qcov=0.408; evalue=5.7e-36; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=52.5; qcov=0.985; evalue=2.26e-123; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026049

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811809.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057811809.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811809.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811809.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47994320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C3
`Chr5:47994337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C1,C76
`Chr5:47994358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B60,B79
`Chr5:47994388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C11,C69
`Chr5:47994392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,D7
`Chr5:47994424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C3
`Chr5:47994444`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B131,B53
`Chr5:47994444`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B131,B53
`Chr5:47994474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,D7
`Chr5:47994497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,B79
`Chr5:47994517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B132,B68
`Chr5:47994533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811809.1

338 aa

169

338

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 71-273 aa PF13359 DDE_Tnp_4 124-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811809.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	71	273	3e-89	298.8	Plant transposon protein
`XP_057811809.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	124	265	6e-09	36.4	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955826.1
ATGAGCAACTACTCACCCTTTTTCACATTGAGGCAAGATGTAACTGGAAGGAATGGTCTATCACCACTCCAAAAGTGCACCGCAGCTATTCGACAGTTTGCATATGCGGCTCCCGGTGATTCATTTGATGAGTACATGCGGATGGGTGAGAGTACTGCTTTGGAATATCTACATGAATTTTGCAGGAGTATGATTGCTGTTTATGGTGATCGATATTTGAGGACTCCAAATGCATTAGATACTGAACGCTTGCTACAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026049
ATGAGCAACTACTCACCCTTTTTCACATTGAGGCAAGATGTAACTGGAAGGAATGGTCTATCACCACTCCAAAAGTGCACCGCAGCTATTCGACAGTTTGCATATGCGGCTCCCGGTGATTCATTTGATGAGTACATGCGGATGGGTGAGAGTACTGCTTTGGAATATCTACATGAATTTTGCAGGAGTATGATTGCTGTTTATGGTGATCGATATTTGAGGACTCCAAATGCATTAGATACTGAACGCTTGCTACAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811809.1
MSNYSPFFTLRQDVTGRNGLSPLQKCTAAIRQFAYAAPGDSFDEYMRMGESTALEYLHEFCRSMIAVYGDRYLRTPNALDTERLLQMHEERHSFPGMLGSLDYMHWEWRNCPVAYKEYYTRGDHGVPTIVLEAVASADLWIWHAFFGVAGASNDINVLHGSPLFNQFLQGNAPPVQFTVNGRMYNKGYYLTNGIYPTWASFVKSYPAPGDPVRGKFAQRQEAARKDVERAFGVLQARWAVVRNPVRSYFKEDLRNIMLTC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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