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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003669`

染色体: Chr05 坐标: 49641705-49642292 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003669`
名称	SmilChr05G003669
描述	uncharacterized SmilChr05G003669
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	49641705 - 49642292 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026073`
GeneID	`131026073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026073`
原始查询	`LOC131026073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=27.7; qcov=1; evalue=5.52e-18; confidence=low
Rice	`gene-orf258` (orf258) - identity=23.6; qcov=0.979; evalue=2.97e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811831.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811831.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811831.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811831.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811831.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:49641712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2
`Chr5:49641723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B94,C28
`Chr5:49641742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B84,B94
`Chr5:49641758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr5:49641784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr5:49641790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C39
`Chr5:49641808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	41	A1,A16,A18,B100,B101,B108,B110,B12,B138,B21,B28,B36,B5,B60,B64,B66,B69,B74,B76,B9,C1,C11,C18,C20,C21,C24,C32,C35,C37,C52,C53,C60,C62,C68,C7,C70,C76,C79,C87,D1,D10
`Chr5:49641816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,D11
`Chr5:49641836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B13,C28,C82
`Chr5:49641836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C28,C82
`Chr5:49641837`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B63,B79,C10,C67
`Chr5:49641837`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B63,B79,C10,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811831.1

195 aa

195

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 48-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811831.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	48	141	9.5e-17	62.2	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955848.1
ATGGAGCTTAACCCTTCGTGGGACATGGACAAACTGGAAGCGATTGTACCTCGGGATGAACTTTGGAAATTCACAGATAACTTTAAGATTAAACCGACTGTTTCTGATAGACCCATTTGGCCGACAGGGAAGGGAAATGCTTTTTCGGTTAAATCAGGGTATTTACTTGCGAGTTCCCTTAGGAGTTCTCATGAAGCTTCGACGTCGGTGGATGACTCTGAGCTGTGGAATTGGGTGTGGGGTCTGGAAGTTATACCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026073
ATGGAGCTTAACCCTTCGTGGGACATGGACAAACTGGAAGCGATTGTACCTCGGGATGAACTTTGGAAATTCACAGATAACTTTAAGATTAAACCGACTGTTTCTGATAGACCCATTTGGCCGACAGGGAAGGGAAATGCTTTTTCGGTTAAATCAGGGTATTTACTTGCGAGTTCCCTTAGGAGTTCTCATGAAGCTTCGACGTCGGTGGATGACTCTGAGCTGTGGAATTGGGTGTGGGGTCTGGAAGTTATACCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811831.1
MELNPSWDMDKLEAIVPRDELWKFTDNFKIKPTVSDRPIWPTGKGNAFSVKSGYLLASSLRSSHEASTSVDDSELWNWVWGLEVIPKVKLFLWKCLSGSLPTAQALVSRSVELQPWCRRCGEEMESIEHAIRDCSWAAFLWEISPLRLTPVNQSDPWNVKVWVERIRSIPDKEVHNLFASLCWACWYAQNLCLSG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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