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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003724`

染色体: Chr05 坐标: 50345311-50346372 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003724`
名称	SmilChr05G003724
描述	uncharacterized SmilChr05G003724
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50345311 - 50346372 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026090`
GeneID	`131026090`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026090`
原始查询	`LOC131026090`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=47.1; qcov=0.397; evalue=8.91e-29; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=50.9; qcov=0.935; evalue=1.45e-118; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026090

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811846.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057811846.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811846.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811846.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811846.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50345335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr5:50345341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr5:50345349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B33
`Chr5:50345356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B59,B89
`Chr5:50345356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B89
`Chr5:50345365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A1,A8,B127,B140,B2,B23,B38,B93,C46,C74,C75,D8
`Chr5:50345372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:50345384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C48
`Chr5:50345392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A23,A9,B105,B109,B110,B115,B118,B12,B19,B31,B48,B55,B64,B7,B71,B78,B98,C11,C23,C25,C33,C57,C62,C69,C71
`Chr5:50345395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr5:50345432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D11
`Chr5:50345443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B104,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811846.1

353 aa

176

353

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 61-98 aa PF04827 Plant_tran 169-346 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811846.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	61	98	2.3e-14	53.6	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057811846.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	169	346	1.4e-72	244.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955863.1
ATGTCTGATACTCCTAGTCCACATGAAATTGATGAAATGTGGAAGCAATACCTTCGAAATTCGGCAACCAATCCGATTATGCGAGAGATGATTGCTATGCTTGATGCAGATGAAGCAACAACGCAAAGTTCACGAAGGAGAAACGGTCCTAGAAAATATAGGGACCGGGAGCGTGAAAGAGGCCATGATCGTCTCGTTCGTGATTATTCCTGTGATGAACCCATCTATGATGGCGATCTTTTTCGCTGTCGGTTTCAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026090
ATGTCTGATACTCCTAGTCCACATGAAATTGATGAAATGTGGAAGCAATACCTTCGAAATTCGGCAACCAATCCGATTATGCGAGAGATGATTGCTATGCTTGATGCAGATGAAGCAACAACGCAAAGTTCACGAAGGAGAAACGGTCCTAGAAAATATAGGGACCGGGAGCGTGAAAGAGGCCATGATCGTCTCGTTCGTGATTATTCCTGTGATGAACCCATCTATGATGGCGATCTTTTTCGCTGTCGGTTTCAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811846.1
MSDTPSPHEIDEMWKQYLRNSATNPIMREMIAMLDADEATTQSSRRRNGPRKYRDRERERGHDRLVRDYSCDEPIYDGDLFRCRFQMRRDLFVKIVDATSNYSPFFTLRQDATGRNGLSPLQKCTAAIRQLAYAAPGDSLDEYMRMGESTALECLHEFCRSMIAVCGDRYLRTPNAANTERLLQMHEERHGFPGMLRSLDCMHWEWRNCPVAYKGYYTRGNHGVSTIVLEAAASVDLWISHAFFGVAGGSNDINVLHGSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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