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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004041`

染色体: Chr05 坐标: 54388183-54390280 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004041`
名称	SmilChr05G004041
描述	secreted RxLR effector protein 161-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54388183 - 54390280 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026129`
GeneID	`131026129`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026129`
原始查询	`LOC131026129`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	secreted RxLR effector protein 161-like
产物	secreted RxLR effector protein 161-like
Arabidopsis	`ATMG00810` - identity=35.5; qcov=0.631; evalue=4.44e-26; confidence=medium
Rice	`Os11g0656500` - identity=46; qcov=0.578; evalue=1.07e-38; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026129

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811881.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811881.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811881.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811881.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811881.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54388197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr5:54388198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B76,C35,D11
`Chr5:54388213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B9,C38
`Chr5:54388221`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr5:54388221`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr5:54388319`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B120,C77
`Chr5:54388319`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B120,C77
`Chr5:54388322`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B120,C77
`Chr5:54388322`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B120,C77
`Chr5:54388325`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B120,C77
`Chr5:54388325`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B120,C77
`Chr5:54388363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811881.1

263 aa

132

263

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 153-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811881.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	153	188	1.6e-05	25.3	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955898.1
ATGGAGGACTGCAAGGCAATCAACTCACCTGTAGAGTGTGGGATCAAATTATCCAAGAACGATGGAGGAGAAAAGGTGGACCTGACATTATTCAAGAGTTTGGTAGGAAGCCTACGATACTTAACTTGCACAAGGCCATACATACTTTATGGCACAAGGCTCGTAAGTCGCTATATGGAGGTTCCAACCACTATGCATATGAAGGTAGCAAAGAGAATTCTTCACTATCTCAAAGGTACGATCAACTATGGCCTGCTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026129
ATGGAGGACTGCAAGGCAATCAACTCACCTGTAGAGTGTGGGATCAAATTATCCAAGAACGATGGAGGAGAAAAGGTGGACCTGACATTATTCAAGAGTTTGGTAGGAAGCCTACGATACTTAACTTGCACAAGGCCATACATACTTTATGGCACAAGGCTCGTAAGTCGCTATATGGAGGTTCCAACCACTATGCATATGAAGGTAGCAAAGAGAATTCTTCACTATCTCAAAGGTACGATCAACTATGGCCTGCTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811881.1
MEDCKAINSPVECGIKLSKNDGGEKVDLTLFKSLVGSLRYLTCTRPYILYGTRLVSRYMEVPTTMHMKVAKRILHYLKGTINYGLLYSNTNQYKLVGYSDNDWAGDIDDHKSRSGFVFFMEDTAFMWMSKKQPIVTLSTYEAEYVAATSTVCVPSESAFSAGARTITDRRTRLNPKSIKCCMLLKNWLDEEYRLKNLKRLERYKIAEMNEDEDSEDGEPDIEIRAQGDENEPDIERFYFPTMDYTYSSSQDPDFTYEWQH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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