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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004133`

染色体: Chr05 坐标: 55309027-55324224 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004133`
名称	SmilChr05G004133
描述	uncharacterized SmilChr05G004133
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55309027 - 55324224 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026139`
GeneID	`131026139`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026139`
原始查询	`LOC131026139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=27; qcov=0.576; evalue=2.67e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.6; qcov=0.938; evalue=1.44e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026139

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811891.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811891.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811891.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811891.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811891.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55309039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B71
`Chr5:55309075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,D11
`Chr5:55309081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B107
`Chr5:55309091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr5:55309098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr5:55323560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C32
`Chr5:55323562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A23,B130,B133,B4
`Chr5:55323565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C74
`Chr5:55323565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:55323587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B117
`Chr5:55323591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr5:55323613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A25,A5,B3,B31,B58,C10,C12,C50,C64,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811891.1

257 aa

128

257

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 32-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811891.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	32	126	6e-18	66.0	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955908.1
ATGGTAGAAGCCTTAAAATCTTTTATCTCAGCCTGTTCTCCTCGCGTTGGTTTGAAAGATGGTTGGGATTGGAAGGCAACGAAGGATAGAAGGTTTTCAACAAAATCTGCTTATGAGGTCCTTGAGGCGTCTAGAAATGAAGCACCCCTTTTGACTACCCATAATGAGACGTTTGGGAATATTTGGAACGCTCTGGCTCCTTACAAGGCAAGAGTTACAGCTTGGAGATGCCTTCGCAATAGATTGGCAACTTGTGATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026139
ATGGTAGAAGCCTTAAAATCTTTTATCTCAGCCTGTTCTCCTCGCGTTGGTTTGAAAGATGGTTGGGATTGGAAGGCAACGAAGGATAGAAGGTTTTCAACAAAATCTGCTTATGAGGTCCTTGAGGCGTCTAGAAATGAAGCACCCCTTTTGACTACCCATAATGAGACGTTTGGGAATATTTGGAACGCTCTGGCTCCTTACAAGGCAAGAGTTACAGCTTGGAGATGCCTTCGCAATAGATTGGCAACTTGTGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811891.1
MVEALKSFISACSPRVGLKDGWDWKATKDRRFSTKSAYEVLEASRNEAPLLTTHNETFGNIWNALAPYKARVTAWRCLRNRLATCDNLIKRKVALQAEDSWCNSCVAHEETAVHLFLHCPKAEQVWDLIQQWIGQRTARPQGILQHFSIFAHGGKGKSSRKFLKALWICTIWLIWKNRNVSRFEGKVWDAQQMVLEIKGRMWSWNQTFGIVVSDAIFSKWCSHLENFLRGDDFPLYGTVTVTFLDCLVVQYGSVKLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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