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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002559`

染色体: Chr01 坐标: 43731427-43738108 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002559`
名称	SmilChr01G002559
描述	uncharacterized SmilChr01G002559
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43731427 - 43738108 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026143`
GeneID	`131026143`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026143`
原始查询	`LOC131026143`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0712400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0712400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G11860` (AT4G11860) FAM63A-like protein (DUF544) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826793] identity=69.8; qcov=0.351; evalue=2.38e-107; confidence=low
Rice	`Os06g0712400` - identity=46.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0016807 (cysteine-type carboxypeptidase activity); GO:0071108 (protein K48-linked deubiquitination); GO:0071944 (cell periphery); GO:1990380 (K48-linked deubiquitinase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04424 (MINDY_DUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026143

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811898.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811898.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057811898.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057811898.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057811898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43731564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B74
`Chr1:43731592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:43731594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B71
`Chr1:43732861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr1:43733967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B4,B61
`Chr1:43734293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D4,D7
`Chr1:43734330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:43734423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:43734471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr1:43736826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C40
`Chr1:43736902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811898.1

698 aa

349

698

MINDY_DUB

PF04424 MINDY_DUB 30-586 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811898.1`	Pfam	`PF04424`	MINDY_DUB	Domain	30	586	7.4e-91	304.8	MINDY deubiquitinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955915.1
CTCCCCAAATCATTTCTTATATTTCCCGTCTACAACTGCTATCGTCACTCCACCGCTGTTTCAGTTTTGTAGTAGAAAGAATATTTTATTTGATCATTTGCGAAACAACTCCACAAATGGATTCTTCGCCTCAGTCTGGTTCACCCTCCGCCGCCCCGCCGCCTCCGCCGGCCGAGCCGGAGTCCAAGCGCGAGAAGGAGATGGTGCATAAAACTAAAGTAATTCAATTTCTTGGGCGAACTGCGCCTATCATTCTCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026143
ATGGATTCTTCGCCTCAGTCTGGTTCACCCTCCGCCGCCCCGCCGCCTCCGCCGGCCGAGCCGGAGTCCAAGCGCGAGAAGGAGATGGTGCATAAAACTAAAGTAATTCAATTTCTTGGGCGAACTGCGCCTATCATTCTCCAGAATGATAACGGCCCATGCCCTCTCCTCGCTATCTGTAATGTGCTTTCTCTAAAGAACAATTTGAATCTGAGCCCAGATATTCCAGAGGTTTCCCAGGAGAAATTGCTTTCGCTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811898.1
MDSSPQSGSPSAAPPPPPAEPESKREKEMVHKTKVIQFLGRTAPIILQNDNGPCPLLAICNVLSLKNNLNLSPDIPEVSQEKLLSLVAERLIDSNTNIDNKEAGYVENQLQNIADAIDLLPRLTTGIDVNLKFRRIDDFEFTPECAIYDLLDIPLYHGWIVDPQDHETADAIGSKSYNTLMGELVSLEAKSITSDEKKNSEDDSVDFVAATTAALGIPSPSLSRGQSFNDSPQQARKGDIEEEEELLRALRLSEMENSNP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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