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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004140`

染色体: Chr05 坐标: 55369528-55369854 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004140`
名称	SmilChr05G004140
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00300-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55369528 - 55369854 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026144`
GeneID	`131026144`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026144`
原始查询	`LOC131026144`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=ATMG00300; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	hit=ATMG00300; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`ATMG00300` - identity=39.5; qcov=1.01; evalue=2.54e-22; confidence=medium
Rice	`Os08g0125300` - identity=32.4; qcov=0.685; evalue=3.74e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13976 (gag_pre-integrs)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026144

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811895.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057811895.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811895.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811895.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811895.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55369552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr5:55369566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B53
`Chr5:55369628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr5:55369692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B91,C37,D9
`Chr5:55369708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C23
`Chr5:55369708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:55369725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C15
`Chr5:55369766`	`G`	`GA`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B132,C15
`Chr5:55369766`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B132,C15
`Chr5:55369775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B91,C37
`Chr5:55369792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr5:55369794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811895.1

108 aa

108

gag_pre-integrs

PF13976 gag_pre-integrs 21-85 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811895.1`	Pfam	`PF13976`	gag_pre-integrs	Domain	21	85	3.9e-16	59.3	GAG-pre-integrase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955912.1
ATGGGTTTTCTATATGTCATGAAAGAAGGCATAGTGGTGCTGAAGGAGGTGAGAAAGAACAACTTATATTGTCTTGTGGGATCAACAGTAGTTAGTGAAACTGAAGCATATATGGCTAGTGAAGCAGAGCTATGGCATAAAAGACTAGCTCATGTAGGAGAAAAGGGAATCAAAGAGCTACAGAAGCAGAATCTACTGAGTATCATCACTCTTGTGAAACTCAAAATTTGCGAAGATTGCATTCTAGGGAAGAGCAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026144
ATGGGTTTTCTATATGTCATGAAAGAAGGCATAGTGGTGCTGAAGGAGGTGAGAAAGAACAACTTATATTGTCTTGTGGGATCAACAGTAGTTAGTGAAACTGAAGCATATATGGCTAGTGAAGCAGAGCTATGGCATAAAAGACTAGCTCATGTAGGAGAAAAGGGAATCAAAGAGCTACAGAAGCAGAATCTACTGAGTATCATCACTCTTGTGAAACTCAAAATTTGCGAAGATTGCATTCTAGGGAAGAGCAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811895.1
MGFLYVMKEGIVVLKEVRKNNLYCLVGSTVVSETEAYMASEAELWHKRLAHVGEKGIKELQKQNLLSIITLVKLKICEDCILGKSKKIPYPTSRMSTKEPFEYVHGDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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