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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004143`

染色体: Chr05 坐标: 55385619-55386542 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004143`
名称	SmilChr05G004143
描述	probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55385619 - 55386542 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026145`
GeneID	`131026145`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026145`
原始查询	`LOC131026145`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA1
产物	probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA1
Arabidopsis	`AT4G32540` (YUC1) Flavin-binding monooxygenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829389] identity=69.6; qcov=0.558; evalue=1.18e-45; confidence=medium
Rice	`Os01g0645400` (YUCCA1) - identity=56.8; qcov=0.573; evalue=1.95e-38; confidence=medium
GO	-
KEGG	smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026145

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057811896.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057811896.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811896.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811896.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811896.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55385871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B102,B130,B55
`Chr5:55385893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B102,B130,B55
`Chr5:55385895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B102,B130,B55
`Chr5:55385905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:55385909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C16,C74
`Chr5:55385912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:55385927`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B102
`Chr5:55385927`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B102
`Chr5:55385933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:55385941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr5:55385955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:55385965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955913.1
ATGTGGGGAGTTTCGACGTTTTCAATGGCGATGGTGCTACTGAAATGGCTGCCATTGAAGCTGGTCGATAAGTTTCTCCTCCTCGTCGCCAACTTCAAATTCGGCAACACCGCTAGATTAGGTCTCCGCCTCCCCAAATTCGGCCCTCTGGAGCTAAAAAATGCCACCGAAAAATCCCCCGTCCTCGACGTTGGCGCCCTCTCTCTCATCAAATCCGGTAAAATTGAGGTCGTGGAAGGAGTGAAGGAGATAATGAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026145
ATGTGGGGAGTTTCGACGTTTTCAATGGCGATGGTGCTACTGAAATGGCTGCCATTGAAGCTGGTCGATAAGTTTCTCCTCCTCGTCGCCAACTTCAAATTCGGCAACACCGCTAGATTAGGTCTCCGCCTCCCCAAATTCGGCCCTCTGGAGCTAAAAAATGCCACCGAAAAATCCCCCGTCCTCGACGTTGGCGCCCTCTCTCTCATCAAATCCGGTAAAATTGAGGTCGTGGAAGGAGTGAAGGAGATAATGAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811896.1
MWGVSTFSMAMVLLKWLPLKLVDKFLLLVANFKFGNTARLGLRLPKFGPLELKNATEKSPVLDVGALSLIKSGKIEVVEGVKEIMKNGAKFCDGQERDFDFIILETPHISVSPSPLSLSLPDSLFLSPLLTDRNKGSRPKRVSIAHEMLVDPSLLILDEPTSGLDATAAYRPMAALGGLAARGKTVVMSVHQLSSRAYQMFDDLGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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