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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004145`

染色体: Chr05 坐标: 55397529-55398026 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004145`
名称	SmilChr05G004145
描述	probable calcium-binding protein CML46
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55397529 - 55398026 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026146`
GeneID	`131026146`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026146`
原始查询	`LOC131026146`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable calcium-binding protein CML46
产物	probable calcium-binding protein CML46
Arabidopsis	`AT5G39670` (AT5G39670) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833963] identity=51.8; qcov=0.515; evalue=1.24e-21; confidence=medium
Rice	`Os12g0140050` - identity=36.5; qcov=0.764; evalue=4.07e-19; confidence=low
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026146

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811897.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057811897.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057811897.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811897.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811897.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55397537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B56,B96
`Chr5:55397594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,D10
`Chr5:55397937`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A18,A23,A24,B124,B131,B140,B53,B65,B7,C17,C29,C46,C62,C9,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811897.1

165 aa

165

EF-hand_7

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_5

PF13499 EF-hand_7 94-160 aa PF13202 EF-hand_5 97-121 aa PF13833 EF-hand_8 109-163 aa PF00036 EF-hand_1 135-162 aa PF13202 EF-hand_5 143-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811897.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	94	160	2.9e-14	53.9	EF-hand domain pair
`XP_057811897.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	97	121	6.6e-11	41.9	EF hand
`XP_057811897.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	109	163	1.2e-08	35.3	EF-hand domain pair
`XP_057811897.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	135	162	2.6e-12	46.1	EF hand domain
`XP_057811897.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	143	160	6.6e-11	41.9	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955914.1
ATGGAGGATTTTTTTGCAAGAATCCATTTCTTCCTCCATGATTTTCCAAAGTATTTATCAGGAAAATGGAATATTTTCTGGGGTGGAAATATCGAAAAATCCAACGCTTCTTCGCACTGCTACACAGAAAATTCAGCAAATGAGAAACGAAAAATCCCATTTGCAGAAATCAACTCGATTTTGAGTAGAGTTGGAATAGTGGGATTGGATGATTGCGAGAATAAAAGCAACCTGGATGAGGAAGATTTAGTGGGGCTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026146
ATGGAGGATTTTTTTGCAAGAATCCATTTCTTCCTCCATGATTTTCCAAAGTATTTATCAGGAAAATGGAATATTTTCTGGGGTGGAAATATCGAAAAATCCAACGCTTCTTCGCACTGCTACACAGAAAATTCAGCAAATGAGAAACGAAAAATCCCATTTGCAGAAATCAACTCGATTTTGAGTAGAGTTGGAATAGTGGGATTGGATGATTGCGAGAATAAAAGCAACCTGGATGAGGAAGATTTAGTGGGGCTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811897.1
MEDFFARIHFFLHDFPKYLSGKWNIFWGGNIEKSNASSHCYTENSANEKRKIPFAEINSILSRVGIVGLDDCENKSNLDEEDLVGLFEEEEPSFEEIKESFKVFDVDEDGFVGAADLQRVVLSLGLKEGGCSLDECNKMIKPFDVNGDGFIDFQEFVSFMERCLC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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