当前解析结果
SmilChr05G004266| 统一新 Gene ID | SmilChr05G004266 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G004266 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G004266 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 56447168 - 56448442 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131026166 |
|---|---|
| GeneID | 131026166 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026166 |
| 原始查询 | LOC131026166 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026166 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811918.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057811918.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811918.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811918.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811918.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:56447689 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C34,C56 |
Chr5:56448203 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A16,B125,B77,B91,C74 |
Chr5:56448222 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr5:56448245 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C72 |
Chr5:56448303 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B65 |
Chr5:56448312 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B107,B128,B61,C43,C49 |
Chr5:56448337 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B35,B82,B83,C3 |
Chr5:56448343 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,C23 |
Chr5:56448347 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C53 |
Chr5:56448371 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 49 | A18,A19,A23,A25,A3,B10,B104,B106,B110,B111,B121,B122,B128,B130,B137,B14,B26,B35,B36,B37,B44,B53,B54,B60,B68,B76,B78,B89,B96,C14,C24,C37,C4,C40,C44,C5,C50,C52,C53,C6,C61,C74,C79,C80,C82,C85,D11,D5,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。