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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002423`

染色体: Chr05 坐标: 26728349-26730154 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002423`
名称	SmilChr05G002423
描述	pectinesterase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26728349 - 26730154 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026197`
GeneID	`131026197`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026197`
原始查询	`LOC131026197`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase-like
产物	pectinesterase-like
Arabidopsis	`AT2G26450` (AT2G26450) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817185] identity=46.2; qcov=0.969; evalue=9.23e-159; confidence=high
Rice	`Os04g0458900` (OsPME14) - identity=50.2; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026197

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057811956.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057811956.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811956.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811956.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811956.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26728552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr5:26728604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,D3
`Chr5:26729055`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr5:26729055`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B137
`Chr5:26729057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B67,C20,C52,C59
`Chr5:26729103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:26729159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,B82,C51,C65
`Chr5:26729161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C47
`Chr5:26729165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B65,B82,B86,C51,C65
`Chr5:26729176`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B82,C47
`Chr5:26729176`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B82,C47
`Chr5:26729281`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A13,B106,B107,B109,B121,B127,B29,B36,B51,B53,B61,B72,B78,B8,B82,B86,C11,C23,C29,C32,C33,C51,C55,C65,C69,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811956.1

545 aa

272

545

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 34-181 aa PF01095 Pectinesterase 231-529 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811956.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	34	181	4e-29	102.5	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057811956.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	231	529	3e-138	460.3	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955973.1
GGATGAATATTAGAATTGATTAAAATAAAAATAGAATTAGAGATCAGTTAATTAAATAAGTATGAATTGGGTTATGTTTATAGTGTTGGCGGGGGCAGTATGGTTGGGGGTTGCGGAGGGCGTTGATGTGGAAGGAGCGCTGCAGTCGGCGGCGTCGGGATCGGTGGAGAAAATCTGCTCATACACGAGCCACGCTGAATCATGCAGCGTGGCCCTGACCCCAGTGGCTAACAACAAAAGCGCGACCTTGACTGACTACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026197
ATGAATTGGGTTATGTTTATAGTGTTGGCGGGGGCAGTATGGTTGGGGGTTGCGGAGGGCGTTGATGTGGAAGGAGCGCTGCAGTCGGCGGCGTCGGGATCGGTGGAGAAAATCTGCTCATACACGAGCCACGCTGAATCATGCAGCGTGGCCCTGACCCCAGTGGCTAACAACAAAAGCGCGACCTTGACTGACTACCTGCAGGCGGCCATCAAGGTGGCGCAGCAAGAGGTGGAGGCGGCCAAGGGGCGGCCGGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811956.1
MNWVMFIVLAGAVWLGVAEGVDVEGALQSAASGSVEKICSYTSHAESCSVALTPVANNKSATLTDYLQAAIKVAQQEVEAAKGRPAEIGKAATKPQEKMAVDDCKELLQFAVDELQASMAAVGESSVHTIAEREAELKNWLSAVLSYHETCIDGFETPEIKEGVSKGLLNATELTDNALAIVGSISNLSKSFNMSIKELPDAAKSLLDGFPGWMKSGDRKLLAAGGEPEPNAVVAQDGSGQYKTIQAALDAYPKDLKGGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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