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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002424`

染色体: Chr05 坐标: 26730260-26734047 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002424`
名称	SmilChr05G002424
描述	50S ribosomal protein L3-2, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26730260 - 26734047 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026198`
GeneID	`131026198`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026198`
原始查询	`LOC131026198`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L3-2, mitochondrial
产物	50S ribosomal protein L3-2%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G17465` (RPL3P) ribosomal protein L3 plastid [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821011] identity=70.1; qcov=1.04; evalue=1.33e-162; confidence=high
Rice	`Os01g0251100` - identity=67; qcov=1.06; evalue=1.92e-156; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005762 (mitochondrial large ribosomal subunit); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00297 (Ribosomal_L3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026198

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057811957.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057811957.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811957.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811957.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811957.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26730607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr5:26731917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr5:26732846`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A3,B2,B28,B46,B53,B7,B96,D5
`Chr5:26732907`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A3,B2,B46
`Chr5:26732907`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A3,B2,B46
`Chr5:26733642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:26733696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B79,D7
`Chr5:26733837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr5:26733863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811957.1

312 aa

156

312

Ribosomal_L3

PF00297 Ribosomal_L3 162-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811957.1`	Pfam	`PF00297`	Ribosomal_L3	Family	162	245	3.3e-20	73.1	Ribosomal protein L3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955974.1
AAGATAGTACGCGAAGTAGAGAAACATAGCTCATGAGCACTAAAACCCTACAAGCACAGCTCAGTTAACTCCGACCCAGTCTCTCTCTCATGTCACCGGCGGAACTAAAACCCCAGAATCCCAACCTCCACAATAACAAATCAGTCAATCGATAATGGCGGCCGCGTCGAGAGGCCTCATTTCTCGTCTCAGGCACCTCCTCTCCGCTGACCCAGCTCTGAGATCCCTATCCTTTGCCGCTAACGCCACCCAGTTGCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026198
ATGGCGGCCGCGTCGAGAGGCCTCATTTCTCGTCTCAGGCACCTCCTCTCCGCTGACCCAGCTCTGAGATCCCTATCCTTTGCCGCTAACGCCACCCAGTTGCGGAGCTTCACCGCCGAGCCAGAATTTGAAACCACCACACCCCGAATCATCGAGCCCAAACCCGGCGTTATGACTCACGATTCCAAGCGTACTGGCGCCATCGCCGTTAAATGTGGAATGACGGCACTCTGGGACAAGTGGGGCGCCAGGGTTCCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811957.1
MAAASRGLISRLRHLLSADPALRSLSFAANATQLRSFTAEPEFETTTPRIIEPKPGVMTHDSKRTGAIAVKCGMTALWDKWGARVPITILWMDDNIVSQVKLPETEGLCALQIGCGQKKEKHLRKPEVGHFRAQGVPMKRKLREFPVTEDALLPVGTTLDVRHFVPGQYVDVTGITKGKGFQGGMKRWGFKGMPASHGASLSHRSIGSTGQRDAPGKVFKGKKMPGHMGVEQRTVKNVWIYKIDPARNLLWVRGQVPGAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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