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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002448`

染色体: Chr05 坐标: 27024194-27026251 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002448`
名称	SmilChr05G002448
描述	apyrase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27024194 - 27026251 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026221`
GeneID	`131026221`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026221`
原始查询	`LOC131026221`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	apyrase-like
产物	apyrase-like
Arabidopsis	`AT3G04080` (APY1) apyrase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819563] identity=49.9; qcov=0.969; evalue=7.64e-132; confidence=high
Rice	`Os11g0439600` - identity=50.4; qcov=0.964; evalue=6.81e-133; confidence=high
GO	GO:0009134 (nucleoside diphosphate catabolic process); GO:0016020 (membrane); GO:0017110 (nucleoside diphosphate phosphatase activity)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01150 (GDA1_CD39)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026221

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057811986.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057811986.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811986.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811986.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27024423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C4
`Chr5:27024589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr5:27025385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C75
`Chr5:27025403`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr5:27025403`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B118
`Chr5:27025406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr5:27025419`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B9
`Chr5:27025419`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B9
`Chr5:27025437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2
`Chr5:27025453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:27025574`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B24,B78,B93,C23
`Chr5:27025574`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B24,B78,B93,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811986.1

416 aa

208

416

GDA1_CD39

PF01150 GDA1_CD39 16-415 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811986.1`	Pfam	`PF01150`	GDA1_CD39	Family	16	415	5.5e-102	342.3	GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956003.1
TAGTAAATGAAATGATGTTAAGTATTCCACGGTTTTCACGCTAGTTTCGACAATATCGACCTTTGCTGTTCATCATTGGGGTGGTTTTAAATGAATATAAATATAGAATCGAATGAAGCGAAAGTAAATTCATGAAAAAGATGTTTATAGAACGTTTTTTAGTGCTGTTTTCGTTGGTTGCCTCAGAGCAGCAGAAATATGCAGTAGTTTTTGACGCAGGAAGCACTGGCTCGAGAGTTCATGTGTTCAGCTTCGACAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026221
ATGAAAAAGATGTTTATAGAACGTTTTTTAGTGCTGTTTTCGTTGGTTGCCTCAGAGCAGCAGAAATATGCAGTAGTTTTTGACGCAGGAAGCACTGGCTCGAGAGTTCATGTGTTCAGCTTCGACAGCGATATTGGTCTCCTCAAAATTGACCAAGACTATGAGTTTTATGCGGCTGTAACACCCGGTCTGAGTTCATACCCTGATGACCCCAAGGCTGCAGCCGACTCCTTGAGGCCCCTCTTAGACCAAGCCCAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811986.1
MKKMFIERFLVLFSLVASEQQKYAVVFDAGSTGSRVHVFSFDSDIGLLKIDQDYEFYAAVTPGLSSYPDDPKAAADSLRPLLDQAQAVVPQELRSTTPLKLGATAGLRLLPGNASEAILEAVKEYFEQESSLDYRPEWVSVLEGTDEAAYMWLAINYLLESLRGGFSQTVGVVDLGGGSVQMAYALSESAASNAPPAYVFQKLILGTNYNLYTHSYLNYGLKAARAQSLNISGGAGNPCVTNGYQGTYEYNGEVYNAAPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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