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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002462`

染色体: Chr05 坐标: 27138411-27139676 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002462`
名称	SmilChr05G002462
描述	uncharacterized SmilChr05G002462
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27138411 - 27139676 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026236`
GeneID	`131026236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026236`
原始查询	`LOC131026236`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812007.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812007.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812007.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812007.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057812007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27138774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B82,C78
`Chr5:27138775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B21,B40,B75,B77
`Chr5:27138788`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	38	A18,A22,A23,B110,B111,B12,B122,B129,B132,B134,B137,B140,B16,B22,B45,B48,B49,B6,B60,B83,B97,C10,C16,C24,C28,C31,C39,C43,C44,C56,C58,C6,C67,C71,C79,D11,D4,D6
`Chr5:27138835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B84,B94,C35
`Chr5:27138900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B140
`Chr5:27138903`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A18,A22,A23,B104,B110,B111,B132,B134,B137,B16,B22,B35,B45,B48,B6,B60,B83,B97,C10,C16,C24,C28,C31,C39,C43,C44,C56,C58,C6,C67,C71,C79,D4,D6
`Chr5:27138934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C52,C84
`Chr5:27139268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr5:27139278`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	45	A18,A19,A20,A23,B107,B110,B122,B132,B140,B15,B16,B22,B29,B33,B35,B45,B55,B6,B64,B7,B83,B84,B9,B95,B97,C11,C16,C23,C24,C27,C28,C35,C39,C43,C44,C55,C56,C6,C67,C69,C71,C74,C75,C79,D4
`Chr5:27139316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A13,B130,B136,B58,C33,C4,C82,C9
`Chr5:27139403`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	37	A19,A24,A5,B100,B107,B114,B126,B128,B135,B138,B15,B18,B19,B24,B25,B49,B50,B51,B52,B54,B57,B61,B80,B81,B88,B90,B92,B93,C30,C43,C44,C46,C49,C55,C60,C7,D9
`Chr5:27139409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812007.1

148 aa

148

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 1-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812007.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	1	89	5.5e-06	28.0	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956024.1
TTTCAGCTATAAATATCAGTACAAATCAGCAAGGTACATATTCTCTACAACAAAATTATCAGCCCCTTTCTACATCTCCAAAATGGCATTGTCGGTTCCAACACAAGCTGAATTTTTCTATCAATCTAAATAGAATGCGAAGATGCATGCATTCTTTTTAAGTGTCATAATAACACAATTCAAAATGGGCAACTGGAAAGCGACGAAGATTCCAACAAATGCAATCCATTTAGCGAGAGGATCACTCAATGATGTTTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026236
ATGCATGCATTCTTTTTAAGTGTCATAATAACACAATTCAAAATGGGCAACTGGAAAGCGACGAAGATTCCAACAAATGCAATCCATTTAGCGAGAGGATCACTCAATGATGTTTTCCCAAGCAACCTTACTTGGAATGACGTTTACAAGCGATTTATGCTGATGGAGAATCGTTTTCGTACCTTCAAGGAGGTTATTGCTATTTCGGAGACTTATTGGGATCTCAGCATGAACGGCATCATCGCAGTTGATGGGATATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812007.1
MHAFFLSVIITQFKMGNWKATKIPTNAIHLARGSLNDVFPSNLTWNDVYKRFMLMENRFRTFKEVIAISETYWDLSMNGIIAVDGIWKRIFKKNELAKAYYHVGESEFDKLAILVASENIKVEHSKTVVIISDTTIPLKGGKNKRCPG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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