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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002464`

染色体: Chr05 坐标: 27148144-27152200 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002464`
名称	SmilChr05G002464
描述	cationic amino acid transporter 5
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27148144 - 27152200 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026237`
GeneID	`131026237`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026237`
原始查询	`LOC131026237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cationic amino acid transporter 5
产物	cationic amino acid transporter 5
Arabidopsis	`AT2G34960` (CAT5) cationic amino acid transporter 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818060] identity=74.6; qcov=0.956; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0209800` (OsCAT1) - identity=70.2; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005313 (L-glutamate transmembrane transporter activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006865 (amino acid transport); GO:0015189 (L-lysine transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00324 (AA_permease); PF13520 (AA_permease_2); PF13906 (AA_permease_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026237

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057812008.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057812008.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057812008.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812008.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812008.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27149038`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B12,B140
`Chr5:27149038`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B12,B140
`Chr5:27149041`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B12,B140
`Chr5:27149041`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B12,B140
`Chr5:27149093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,C84
`Chr5:27149123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B125,C12
`Chr5:27149135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B140
`Chr5:27149196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C4,C9
`Chr5:27149279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:27150035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B125,C12
`Chr5:27150065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,D1
`Chr5:27150154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812008.1

586 aa

293

586

AA_permease_2

AA_permease

AA_permease_C

PF13520 AA_permease_2 72-463 aa PF00324 AA_permease 77-440 aa PF13906 AA_permease_C 510-559 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812008.1`	Pfam	`PF13520`	AA_permease_2	Family	72	463	3.5e-45	155.4	Amino acid permease
`XP_057812008.1`	Pfam	`PF00324`	AA_permease	Domain	77	440	3e-30	106.0	Amino acid permease
`XP_057812008.1`	Pfam	`PF13906`	AA_permease_C	Domain	510	559	5.2e-19	68.8	C-terminus of AA_permease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102223.1
CGGAAGATCCTGAGACGCAAAGTCATGGTTTCCAGTGCAAGACAGGCTGTTGCAGGCCTACTAACTGTTGGTGCAGTTCATGGAGTAAAGTATGTCGGGAGCAAAATGAAGAAGGCATGGAGATCGTGGTGGTAATCCTTTTAGGTTTAAACATTAGTGGGTGTTAAAATTTCCCTTGGGTTACTGCTGCTAGTTTCTGACACCGTGAAAGGTAAAATGAGGAAAGTATATCCTCATGTCCTCAACTCTGAAATAATCTG...

XR_009102224.1
CTTGTTATGTAATTAATGTCAAATGCCAGTTTTCTTTCTCTTTGGATTTGTCCCGGCCGTCACCATCTCCCTAGCTGTCCAATCACTGCCATTAGATGATGATTTCTCTTGTAACCCAAACCAGTGGAAGAGATAAGAATGGGAACTGAATCTGATGTCCAACCAAGAAGCTACTGGAGATTCAGCAAGCAAGACTTCTTCCCTGAGAAGTCTTTCGAGAATTGGAGCTCCTACATCTCTGCCCTATCGGAGACCAGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026237
ATGGGAACTGAATCTGATGTCCAACCAAGAAGCTACTGGAGATTCAGCAAGCAAGACTTCTTCCCTGAGAAGTCTTTCGAGAATTGGAGCTCCTACATCTCTGCCCTATCGGAGACCAGGCTGCGGTTCAAGGACCGCCTTCTCAACCGCTCCGATGAAACAACAGAGCTCGTTTATCTCCGCAAACAGAGCGAGAACAGCATGAAACGACAACTCAACTGGTGGGACCTCATCTGGTTCGGATTTGGCTCCGTCATTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812008.1
MGTESDVQPRSYWRFSKQDFFPEKSFENWSSYISALSETRLRFKDRLLNRSDETTELVYLRKQSENSMKRQLNWWDLIWFGFGSVIGTGIFVLTGQEAHDHAGPAIILSYVASGISAMLSVFCYTEFAVEIPVAGGSFAYLRVELGDLAAFIAAGNILLESIIGSAAVARGWTSYFTTLLDRHSNSLRIHTDLKDGFNLLDPLASGVLVIASMIAITSAKKTSYLNWIASAVNTVVIIFVIVAGFAHANTSNLQPFLPYG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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