当前解析结果
SmilChr05G002472| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002472 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002472 |
| 描述 | protein SUPPRESSOR OF FRI 4 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 27225051 - 27229366 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131026246 |
|---|---|
| GeneID | 131026246 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026246 |
| 原始查询 | LOC131026246 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein SUPPRESSOR OF FRI 4 |
| 产物 | protein SUPPRESSOR OF FRI 4 |
| Arabidopsis | AT1G30970 (SUF4)zinc finger (C2H2 type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839984] identity=63.5; qcov=1.03; evalue=2.48e-152; confidence=high |
| Rice | Os09g0560900 (SIP1)- identity=58.2; qcov=1.01; evalue=2.35e-130; confidence=high |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026246 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057812026.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057812026.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057812026.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057812026.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057812026.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:27225426 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C62 |
Chr5:27226357 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B106,B139,C36 |
Chr5:27226454 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B130,B136,B140,B58,C33 |
Chr5:27226933 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B21,B64,B84,B94 |
Chr5:27228623 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B110,B78,C23,D4 |
Chr5:27228960 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B21,B64,B84,B94 |
Chr5:27228966 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
Chr5:27229038 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B125 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。