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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002498`

染色体: Chr05 坐标: 27697230-27699006 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002498`
名称	SmilChr05G002498
描述	sulfiredoxin, chloroplastic/mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27697230 - 27699006 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026272`
GeneID	`131026272`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026272`
原始查询	`LOC131026272`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sulfiredoxin, chloroplastic/mitochondrial
产物	sulfiredoxin%2C chloroplastic/mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G31170` (SRX) sulfiredoxin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840004] identity=68.8; qcov=1.04; evalue=2.15e-52; confidence=high
Rice	`Os06g0174300` (OsSrx) - identity=76.2; qcov=0.908; evalue=2.97e-57; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0032542 (sulfiredoxin activity); GO:0034599 (cellular response to oxidative stress)
KEGG	-
Pfam	PF02195 (ParB_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026272

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057812063.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057812064.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057812063.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057812063.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812063.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27698189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	88	A10,A11,A16,A18,A2,A7,A8,B1,B103,B105,B11,B113,B114,B115,B118,B12,B120,B124,B125,B126,B127,B131,B139,B14,B140,B20,B21,B22,B23,B27,B28,B29,B30,B31,B35,B36,B38,B39,B40,B41,B44,B45,B48,B52,B53,B58,B67,B70,B73,B74,B75,B76,B80,B84,B85,B91,B97,B98,C12,C13,C16,C25,C26,C29,C30,C33,C37,C42,C49,C53,C54,C59,C61,C7,C71,C74,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C86,C9,D11,D4,D5,D8
`Chr5:27698190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	81	A10,A14,A16,A2,A22,A23,A25,A6,A8,A9,B10,B108,B111,B117,B12,B120,B123,B125,B128,B133,B134,B137,B138,B23,B33,B37,B42,B43,B46,B5,B59,B6,B60,B62,B65,B71,B74,B81,B83,B88,B89,B9,B94,B95,C1,C10,C14,C15,C17,C18,C20,C25,C27,C31,C34,C38,C39,C40,C5,C51,C53,C57,C58,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C73,C76,C78,C8,C80,C82,C83,C86,C9,D3,D5,D7
`Chr5:27698216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:27698872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C34,C62,C73,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812063.1

126 aa

126

ParB_N

PF02195 ParB_N 41-124 aa

XP_057812064.1

120 aa

120

ParB_N

PF02195 ParB_N 35-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812063.1`	Pfam	`PF02195`	ParB_N	Domain	41	124	3.1e-15	56.9	ParB N-terminal domain
`XP_057812064.1`	Pfam	`PF02195`	ParB_N	Domain	35	118	2.5e-15	57.2	ParB N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956081.1
GAAGGTAGCTAGTCTTTTTAATTTTTTGGGTATGGTTCTTTCTAGGTGTGTGGGAACGCAGGCAAGATTGAAAATGCACACGCGTTAAACGTTAAATCCATTTTTTTATTAAGGAGATACTATATCGTATTGCATTCCGTCTTTGCCCTCCTCTAATCTAGCTAACGGTAGCCACTCACTCATAAATAGTTTAGGAGAGATGAATCAAGATTGAAGTCTCAATGGCAAATTTTCTACTCCATCTCCCAAACAATTTCAGA...

XM_057956080.1
TAGCTAGTCTTTTTAATTTTTTGGGTATGGTTCTTTCTAGGTGTGTGGGAACGCAGGCAAGATTGAAAATGCACACGCGTTAAACGTTAAATCCATTTTTTTATTAAGGAGATACTATATCGTATTGCATTCCGTCTTTGCCCTCCTCTAATCTAGCTAACGGTAGCCACTCACTCATAAATAGTTTAGGAGAGATGAATCAAGATTGAAGTCTCAATGGCAAATTTTCTACTCCATCTCCCAAACAATTTCAGAGCAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026272
ATGGCAAATTTTCTACTCCATCTCCCAAACAATTTCAGAGCAGTTTCCGTTTCTGCATCTGCTTCCTCTAATGGATCAGGTCCTCAACAAGGGGGGCCAGTGATTCTTGAACTTCCTCTGGATAAAATTCGGAGACCCCTCATGCGTACGAGAGCCAACGACCCTCACAAAGTGAAACAACTCATGGATAGTATTGCTGAAATCGGGCTTCAAGTACCTATTGACGTGCTTCTCGTAGATGGTGAATATTATGGTTTTTC...

LOC131026272
ATGATATTTGACATGGCATTGAAAGTTGAGATGAGTGGTATAGTCAATTGGTTTGTTGAATGTTGCAAATGTAATGGTGTTGGTAATGTAGGATCAGGTCCTCAACAAGGGGGGCCAGTGATTCTTGAACTTCCTCTGGATAAAATTCGGAGACCCCTCATGCGTACGAGAGCCAACGACCCTCACAAAGTGAAACAACTCATGGATAGTATTGCTGAAATCGGGCTTCAAGTACCTATTGACGTGCTTCTCGTAGATGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057812063.1
MIFDMALKVEMSGIVNWFVECCKCNGVGNVGSGPQQGGPVILELPLDKIRRPLMRTRANDPHKVKQLMDSIAEIGLQVPIDVLLVDGEYYGFSGCHRYEAHQRLGLPTIRCKVRRGTKETLRHHLR

XP_057812064.1
MANFLLHLPNNFRAVSVSASASSNGSGPQQGGPVILELPLDKIRRPLMRTRANDPHKVKQLMDSIAEIGLQVPIDVLLVDGEYYGFSGCHRYEAHQRLGLPTIRCKVRRGTKETLRHHLR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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