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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002566`

染色体: Chr05 坐标: 28836591-28841454 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002566`
名称	SmilChr05G002566
描述	probable phospholipid-transporting ATPase 4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	28836591 - 28841454 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026279`
GeneID	`131026279`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026279`
原始查询	`LOC131026279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable phospholipid-transporting ATPase 4
产物	probable phospholipid-transporting ATPase 4
Arabidopsis	`AT1G72700` (AT1G72700) ATPase E1-E2 type family protein / haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843602] identity=56; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0565900` - identity=57.4; qcov=0.525; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0045332 (phospholipid translocation); GO:0140326 (ATPase-coupled intramembrane lipid carrier activity)
KEGG	-
Pfam	PF13246 (Cation_ATPase); PF16209 (PhoLip_ATPase_N); PF16212 (PhoLip_ATPase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026279

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057812071.1`
2	Endosome membrane	内体膜	0.60000	`XP_057812071.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057812071.1`
4	Endosome	内体	0.40000	`XP_057812071.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057812071.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:28836944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B25,D9
`Chr5:28836988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B79,B99,C75
`Chr5:28837025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:28837441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,C86
`Chr5:28837777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr5:28837831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B25,D9
`Chr5:28838218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B31,C83
`Chr5:28838221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:28838263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:28838608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:28839145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:28839201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812071.1

1235 aa

618

1235

PhoLip_ATPase_N

Cation_ATPase

PhoLip_ATPase_C

PF16209 PhoLip_ATPase_N 49-114 aa PF13246 Cation_ATPase 558-747 aa PF16212 PhoLip_ATPase_C 917-1167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812071.1`	Pfam	`PF16209`	PhoLip_ATPase_N	Family	49	114	7.1e-24	84.0	Phospholipid-translocating ATPase N-terminal
`XP_057812071.1`	Pfam	`PF13246`	Cation_ATPase	Family	558	747	6.4e-20	72.4	P-type ATPase, cytoplasmic domain N
`XP_057812071.1`	Pfam	`PF16212`	PhoLip_ATPase_C	Family	917	1167	1.7e-86	290.8	Phospholipid-translocating P-type ATPase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956088.1
AATCTCTTGTTTCCTGGCTTTCACGTAATTTTTAAAATTTAAAAAATTAACAAGAATTAAAGAAAGAATGGACGTGAATAAACCAAGAATGACAGACAAGCAGAAATGAACAAATCTAATGAAGTCTGCTGTTTTGGATTAAGATTTCTTTCTTGTAGTTAGTGTTGTGTTTTTCCCATATTCGAACATCATAGATATATTCGACGTTGCTTGAGTGTAGGGACGACAGCTAATGATAGGAAGATTCAATGAAAACAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026279
ATGAATGGTGAGAGAGAGATGCCGGGGAGGAGGAAGCAGAAGCTGAAATGGAGCAAGCTCTACACATTTTCATGCCTGCGGGCGAGCGCGGATGATTCTGCACCGGCCGATAAACTTCTCGGGCAGCCGGGGTTCTCGCGCGTGGTTCACTGCAACGAGCCGCAGCTGCACCGGAGCAAGCCGTATAAGTATTCGGACAACTATGTCTCGACAACCAAGTACAACGTTGTAACGTTTCTGCCGATAGCTCTGTTTGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812071.1
MNGEREMPGRRKQKLKWSKLYTFSCLRASADDSAPADKLLGQPGFSRVVHCNEPQLHRSKPYKYSDNYVSTTKYNVVTFLPIALFEQFRRVANLYFLLAAILSLTPLAAFNRVSVVAPLVFVIGISMIKEAVEDWHRFLQDRKVNSRKVMVHVGDGLFVRKSWANLVVGDVVKVSKNEYFPSDLLLLCSSYEDGLCYVETMNLDGETNLKAKRSLEATLSLDEETAFCRFKATLRCEDPNPSLYTFVGNLDYNQESYPLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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