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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002510`

染色体: Chr05 坐标: 27856434-27860095 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002510`
名称	SmilChr05G002510
描述	protein argonaute 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27856434 - 27860095 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026282`
GeneID	`131026282`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026282`
原始查询	`LOC131026282`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein argonaute 2-like
产物	protein argonaute 2-like
Arabidopsis	`AT1G31280` (AGO2) Argonaute family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840016] identity=49.2; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0615700` (OsAGO2) - identity=41.5; qcov=0.876; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0035194 (regulatory ncRNA-mediated post-transcriptional gene silencing)
KEGG	-
Pfam	PF02170 (PAZ); PF02171 (Piwi); PF08699 (ArgoL1); PF16486 (ArgoN); PF16487 (ArgoMid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026282

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812077.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057812077.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	1.00000	`XP_057812077.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057812077.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057812077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27856764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,C29,C35,C7
`Chr5:27858051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:27859272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,C9
`Chr5:27859321`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B88
`Chr5:27859321`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B88
`Chr5:27859406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr5:27859735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:27859764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr5:27859767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812077.1

988 aa

494

988

ArgoN

ArgoL1

PAZ

ArgoMid

Piwi

PF16486 ArgoN 164-298 aa PF08699 ArgoL1 311-357 aa PF02170 PAZ 363-486 aa PF16487 ArgoMid 562-620 aa PF02171 Piwi 656-951 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812077.1`	Pfam	`PF16486`	ArgoN	Domain	164	298	1.7e-21	77.8	N-terminal domain of argonaute
`XP_057812077.1`	Pfam	`PF08699`	ArgoL1	Domain	311	357	1.7e-12	47.5	Argonaute linker 1 domain
`XP_057812077.1`	Pfam	`PF02170`	PAZ	Domain	363	486	7.8e-23	81.5	PAZ domain
`XP_057812077.1`	Pfam	`PF16487`	ArgoMid	Domain	562	620	3e-07	31.3	Mid domain of argonaute
`XP_057812077.1`	Pfam	`PF02171`	Piwi	Domain	656	951	1.7e-89	300.8	Piwi domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956094.1
TACATAAGCAAAAGCCCTTTTTCGTCACGTTGCCTTTTTCTCATACCTCTTTTAATACACCCACAACGCCCCTCGCTTAATCATCGTACTAGATTTCTGATTTCTAAGTCTTTTACTCTCAGATTCAAAACCTTATTGACTAGAACTAGAATGGAAGGTGGCAGAGGCAACAACTCCGGGCGTGGGCGTGGCCGCGGCGGCGGCGGTCGGCGCGGTAACTACGACGATCAACAAGGAGGAGGCCGTGGGCGCGGAAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026282
ATGGAAGGTGGCAGAGGCAACAACTCCGGGCGTGGGCGTGGCCGCGGCGGCGGCGGTCGGCGCGGTAACTACGACGATCAACAAGGAGGAGGCCGTGGGCGCGGAAATCAAGGCGGCGGAAGAGGATCGGAGGGTTCCTACCACCAGCCTCCCGCTCGCCCACAGTCGCAGTGGGTCAGTCGGCCTCCGCCGCAAGCGAATCAGCCTCCGCCCCAGCCGGCCTGGGGCTACAGACCACCTGCCCAGCCCGTCCCCGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812077.1
MEGGRGNNSGRGRGRGGGGRRGNYDDQQGGGRGRGNQGGGRGSEGSYHQPPARPQSQWVSRPPPQANQPPPQPAWGYRPPAQPVPVAVGATSGRGRGSTWTGRPWGESSRQPNPLPSPAPAPAPAPVPVGAAARVRSPTSSESGKQRQIEAIRRPDHGGTLAVRKINLVVNHFPISFDEAGTIYHYDVDVKPVAANGNPPAKKVLRKSDLRLIKDLAFPGAELLRTVYDGEKNVFSAIRLGEGQYRVDVPEGEDVRSGSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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