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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002560`

染色体: Chr05 坐标: 28740798-28745363 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002560`
名称	SmilChr05G002560
描述	delta(14)-sterol reductase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	28740798 - 28745363 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026301`
GeneID	`131026301`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026301`
原始查询	`LOC131026301`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	delta(14)-sterol reductase-like
产物	delta(14)-sterol reductase-like
Arabidopsis	`AT3G52940` (FK) Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824460] identity=68.8; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0565600` - identity=65.3; qcov=1.05; evalue=9.23e-177; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0016126 (sterol biosynthetic process); GO:0050613 (Delta14-sterol reductase activity)
KEGG	smil00100 (Steroid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01222 (ERG4_ERG24); PF06966 (DUF1295)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026301

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057812115.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057812115.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812115.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812115.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:28740960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C48
`Chr5:28743671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:28745241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812115.1

369 aa

184

369

ERG4_ERG24

DUF1295

PF01222 ERG4_ERG24 12-369 aa PF06966 DUF1295 205-314 aa

XP_057812116.1

350 aa

175

350

ERG4_ERG24

DUF1295

PF01222 ERG4_ERG24 12-67 aa PF01222 ERG4_ERG24 96-350 aa PF06966 DUF1295 186-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812115.1`	Pfam	`PF01222`	ERG4_ERG24	Family	12	369	2.3e-89	300.9	Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family
`XP_057812115.1`	Pfam	`PF06966`	DUF1295	Family	205	314	7e-07	29.7	Protein of unknown function (DUF1295)
`XP_057812116.1`	Pfam	`PF01222`	ERG4_ERG24	Family	12	67	3.6e-81	273.9	Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family
`XP_057812116.1`	Pfam	`PF01222`	ERG4_ERG24	Family	96	350	3.6e-81	273.9	Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family
`XP_057812116.1`	Pfam	`PF06966`	DUF1295	Family	186	295	4.7e-07	30.2	Protein of unknown function (DUF1295)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956133.1
CAGCTTCACACACACTTACTTACTATCTGTGAAATATTCCCCATTAATTTTGTATTAAGCTCAAACATTTTTTTTTAAAGCGGAGATAGTGATTGAATCTCAAGTTGAGGATGGATCTCAGTCTGCTTCTCCTTGCCTTCACTCCTTCATGGACTTCGGTCGCTATGCTGCTCGGATATGTCACTTATCTGGCGATTGTTGGATCCATTTTACCGGGTAAAGTTGTACCTGGAGTGACTTTATCCGATGGAACTCGCCTG...

XM_057956132.1
CAGCTTCACACACACTTACTTACTATCTGTGAAATATTCCCCATTAATTTTGTATTAAGCTCAAACATTTTTTTTTAAAGCGGAGATAGTGATTGAATCTCAAGTTGAGGATGGATCTCAGTCTGCTTCTCCTTGCCTTCACTCCTTCATGGACTTCGGTCGCTATGCTGCTCGGATATGTCACTTATCTGGCGATTGTTGGATCCATTTTACCGGGTAAAGTTGTACCTGGAGTGACTTTATCCGATGGAACTCGCCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026301
ATGGATCTCAGTCTGCTTCTCCTTGCCTTCACTCCTTCATGGACTTCGGTCGCTATGCTGCTCGGATATGTCACTTATCTGGCGATTGTTGGATCCATTTTACCGGGTAAAGTTGTACCTGGAGTGACTTTATCCGATGGAACTCGCCTGCATTACCGTTGTAACGGTTTATTATTGCTTTTTTTATTGGTTTTTCTGCTTGGAATTGGTGGCTGGATGGATCTCTTATCACCTACTGTAACAAATCTTCTCTACATGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057812115.1
MDLSLLLLAFTPSWTSVAMLLGYVTYLAIVGSILPGKVVPGVTLSDGTRLHYRCNGLLLLFLLVFLLGIGGWMDLLSPTAIADRGLELLSATLVFSVLVTNLLYMVGCRSRDQSSSFKPHTTGNLIEDWWFGIQLNPQFMGLDLKFYFVRAGMLGWLLINLSVLVKCIQESNLSQSMILYQLFCVIYIMDYFVHEEYMTSTWDIIAERLGFMLVFGDIVWIPFTFSIQGWWLLRNKVEMTTAAIIANCLVFFMGYLVFRG...

XP_057812116.1
MDLSLLLLAFTPSWTSVAMLLGYVTYLAIVGSILPGKVVPGVTLSDGTRLHYRCNGLLLLFLLVFLLGIGGWMDLLSPTVTNLLYMVGCRSRDQSSSFKPHTTGNLIEDWWFGIQLNPQFMGLDLKFYFVRAGMLGWLLINLSVLVKCIQESNLSQSMILYQLFCVIYIMDYFVHEEYMTSTWDIIAERLGFMLVFGDIVWIPFTFSIQGWWLLRNKVEMTTAAIIANCLVFFMGYLVFRGANKQKHVFKKNPKALIWGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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