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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002518`

染色体: Chr05 坐标: 27976015-27977514 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002518`
名称	SmilChr05G002518
描述	BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27976015 - 27977514 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026304`
GeneID	`131026304`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026304`
原始查询	`LOC131026304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 1-like
产物	BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 1-like
Arabidopsis	`AT5G45100` (BRG1) SBP (S-ribonuclease binding protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834543] identity=46.3; qcov=1.01; evalue=1.79e-81; confidence=high
Rice	`Os04g0403200` (SIP23) - identity=31.9; qcov=0.647; evalue=4.67e-27; confidence=low
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0043067 (regulation of programmed cell death)
KEGG	-
Pfam	PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026304

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812125.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812125.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812125.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812125.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057812125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27976120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr5:27976216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:27976268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:27976315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr5:27976326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C28,C41,D10
`Chr5:27976333`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B101,B20,B40,B48,B7,B98,C60,C61
`Chr5:27976384`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	93	A11,A13,A14,A19,A2,A25,A3,A7,B1,B102,B104,B106,B109,B11,B110,B112,B115,B121,B122,B125,B13,B131,B139,B140,B15,B16,B2,B21,B24,B25,B29,B3,B30,B32,B34,B35,B40,B45,B47,B54,B55,B56,B6,B62,B65,B68,B71,B72,B73,B75,B78,B79,B80,B82,B83,B89,B93,B95,B96,C10,C11,C12,C15,C23,C26,C36,C39,C40,C42,C45,C48,C52,C55,C56,C57,C63,C65,C67,C69,C70,C71,C73,C75,C78,C8,C84,C86,C87,D11,D2,D4,D6,D7
`Chr5:27976454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B80
`Chr5:27976462`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A5,B20,B40,B48,B7,B98,C60,C61
`Chr5:27976618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A18,A23,A6,B113,B117,B128,B136,B23,B31,B4,B51,B56,B68,B81,B87,B9,B96,C17,C18,C3,C30,C42,C44,C46,C49,C57,C82,C84,C87,D1
`Chr5:27976782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A18,A23,A6,B113,B117,B128,B136,B23,B31,B4,B56,B68,B75,B81,B87,B9,B96,C17,C18,C3,C30,C42,C44,C46,C49,C54,C57,C82,C84,C87,D1,D4
`Chr5:27976848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	108	A10,A14,A18,A19,A20,A23,A24,A3,A5,A6,B1,B10,B101,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B133,B135,B136,B16,B2,B20,B23,B24,B25,B26,B28,B31,B4,B42,B43,B45,B48,B49,B51,B52,B54,B56,B57,B59,B6,B61,B63,B64,B66,B68,B7,B71,B75,B77,B8,B80,B81,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B96,B98,C17,C18,C20,C22,C27,C30,C40,C42,C44,C46,C49,C50,C51,C53,C54,C55,C57,C59,C60,C61,C67,C72,C73,C76,C79,C80,C82,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D4,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812125.1

320 aa

160

320

zf-C3HC4_3

PF13920 zf-C3HC4_3 267-312 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812125.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	267	312	1e-10	42.0	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956142.1
TTTATTGAGAGAATTAAATTGACATATTTTGTTTATCTTAATCTGCATAATCGGCCATACTGTTTGCTGAATTCAATGTAAAAATATACTCTCCGTTTCTCTCTCTAGATTGATTGACTTTCCTAAACCTTCTCTCTCATCCCACACCAAACGCTTTAAATAAATACCACAACCCCATCCCATTCCTCTAGTTCCCTCACTGCATGCTCCTCTCACATTTCTCTCTCTAAAAATCAAAACAACAAAACGCATCAACTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026304
ATGGCAGTTGAAGCAAGGCATCTCAATCTCTTCCCACCACAACTCATCCAAGACAGAGAGTTGATGAACGCGATTACTCAGGGAAACGGCGCGGCCGCCGCCTACAACGCGCAGCAGATGCGGTTCCTCGGGATCCCCTCCGCCGAGGCATTGCCGGAAAATCAGTTCTACCACCAGGCGGCGGCGGTGTGCGAGGCAAAGACCTCCGTCAACACCGACAGCGGCCTCACCTACAACATTTCCGCCCCGAGAAAGCGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812125.1
MAVEARHLNLFPPQLIQDRELMNAITQGNGAAAAYNAQQMRFLGIPSAEALPENQFYHQAAAVCEAKTSVNTDSGLTYNISAPRKRSRDAFNQFHAVQNFAALPQQQKSSSLNQLPTLAGDDIMPQIHQYQFEIDALISQHTKKIRLELEERQKQQARLLAAAIGEGVMKKLKEKDEQIQRMGKLNLVLQERVKSLYVENQLWRDLAQTNEATANSLRSNLEQVLQQVGGEDGGVVAVEDDVESCCGSSDGGEAQDKDEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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