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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002539`

染色体: Chr05 坐标: 28342113-28343624 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002539`
名称	SmilChr05G002539
描述	(S)-coclaurine N-methyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	28342113 - 28343624 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026313`
GeneID	`131026313`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026313`
原始查询	`LOC131026313`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(S)-coclaurine N-methyltransferase-like
产物	(S)-coclaurine N-methyltransferase-like
Arabidopsis	`AT4G33110` (AT4G33110) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829448] identity=62.6; qcov=0.829; evalue=2.29e-81; confidence=high
Rice	`Os07g0474600` - identity=28.4; qcov=0.552; evalue=3.17e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02353 (CMAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026313

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057812142.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057812142.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057812142.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812142.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812142.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:28343388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,B77,C16
`Chr5:28343402`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B49,C22
`Chr5:28343402`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B49,C22
`Chr5:28343406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr5:28343416`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B74,C16
`Chr5:28343416`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B74,C16
`Chr5:28343423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C16
`Chr5:28343448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C42,C66
`Chr5:28343462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,C54
`Chr5:28343466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C69
`Chr5:28343477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:28343479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812142.1

210 aa

105

210

CMAS

PF02353 CMAS 85-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812142.1`	Pfam	`PF02353`	CMAS	Family	85	181	4.2e-22	79.5	Mycolic acid cyclopropane synthetase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956159.1
TCCTTCCTTCCTCACTTGAATTTTCTGGCAATGGCGGCGGCGAACGGCGGCGTTGTCGATTCGATCGTGCATACGCCCTACGCCGCTACTGTCCGTGTGATGCTCGCTTCACTTGAGCGGAATTTGCTGCCGGATGCCGTCGTGCGCCGCCTCACGCGGCTGCTGCTCGCGAGCCGCCTCCGCTCCGGTTACCGACCGTCAGCTGAAATTCAGCTCTCCGATCTCATACAATTCGCGCATTCTTTGAGAGAGATGCCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026313
ATGGCGGCGGCGAACGGCGGCGTTGTCGATTCGATCGTGCATACGCCCTACGCCGCTACTGTCCGTGTGATGCTCGCTTCACTTGAGCGGAATTTGCTGCCGGATGCCGTCGTGCGCCGCCTCACGCGGCTGCTGCTCGCGAGCCGCCTCCGCTCCGGTTACCGACCGTCAGCTGAAATTCAGCTCTCCGATCTCATACAATTCGCGCATTCTTTGAGAGAGATGCCGATAGCAATCAAGACAAAAGAGCCCAAGTATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812142.1
MAAANGGVVDSIVHTPYAATVRVMLASLERNLLPDAVVRRLTRLLLASRLRSGYRPSAEIQLSDLIQFAHSLREMPIAIKTKEPKYQHYEVPTSFFKLVLGKHLKYSCCFFPDKSSTLEDAEKAMLELYCERSQMKDNYSVLDVGCGWGSLSLYLAQKYPNSQITGICNSTTQKSHIEEQCRYILFFLCIKLWYQKSRMLLYIALIPSGP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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