当前解析结果
SmilChr05G002534| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002534 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002534 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002534 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 28272132 - 28276035 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131026315 |
|---|---|
| GeneID | 131026315 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026315 |
| 原始查询 | LOC131026315 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026315 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057812143.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057812143.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057812143.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057812143.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057812143.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:28272391 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 17 | A14,A19,B101,B109,B11,B122,B140,B15,B29,B34,B72,B73,B83,B95,C55,C57,C71 |
Chr5:28272403 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B78,B93,C69,D4 |
Chr5:28272425 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B133,B59,B63,C49 |
Chr5:28272427 |
CAA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 7 | A24,B100,B125,B45,B92,C31,C84 |
Chr5:28272435 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B78,B93,C11,C69,D4 |
Chr5:28272495 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A18,A8,B140 |
Chr5:28272495 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | A18,A8,B140 |
Chr5:28272498 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | A18,A8,B140 |
Chr5:28272498 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | A18,A8,B140 |
Chr5:28272523 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C68 |
Chr5:28272647 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D2 |
Chr5:28272661 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C12,C47,C79,C84 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。