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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002525`

染色体: Chr05 坐标: 28098986-28100978 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002525`
名称	SmilChr05G002525
描述	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	28098986 - 28100978 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026321`
GeneID	`131026321`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026321`
原始查询	`LOC131026321`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC1
产物	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC1
Arabidopsis	`AT1G68400` (AT1G68400) leucine-rich repeat transmembrane protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843169] identity=51.3; qcov=0.729; evalue=2.31e-25; confidence=medium
Rice	`Os12g0145900` - identity=50; qcov=0.361; evalue=4.25e-15; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026321

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057812155.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057812155.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057812153.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057812153.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812155.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:28099411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr5:28099439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr5:28099842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B61,B74,C53
`Chr5:28099850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr5:28100277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812153.1

185 aa

185

PK_Tyr_Ser-Thr

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 87-149 aa

XP_057812154.1

184 aa

184

PK_Tyr_Ser-Thr

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 87-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812153.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	87	149	9.1e-06	25.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057812154.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	87	146	2.2e-05	24.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956173.1
TGTCCACTTTCATATTGTAAAGATAAAAAATGTCCACTAAGATAAAAATAATAAATTTTGTCCACTTTATGGTTGAAATGACGAAAATGCCCCTCAGCCTAAAATAGGCCATTTCATCTCATCTCCCTCTTTCACGGTTTCACTCACCCTCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTCGAGCTCAGATCGCCGGCGAAGCGCCGCTGCCCCGGCCTCGTCGCCTCCGCCATCTCCTGCTTCACCCCCCGCCGCG...

XM_057956172.1
GTCCACTTTCATATTGTAAAGATAAAAAATGTCCACTAAGATAAAAATAATAAATTTTGTCCACTTTATGGTTGAAATGACGAAAATGCCCCTCAGCCTAAAATAGGCCATTTCATCTCATCTCCCTCTTTCACGGTTTCACTCACCCTCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTCGAGCTCAGATCGCCGGCGAAGCGCCGCTGCCCCGGCCTCGTCGCCTCCGCCATCTCCTGCTTCACCCCCCGCCGCGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131026321
ATGAAAGACAATTCAGACGTCGACGCCGTGGGAGAGAGGGGCGGCGGCGTCGGAGACGGTGATTGCGATGGTTTGAAGCGGCGGAGAAGACGTGAGGTTGAGGAGTGGCGGGACGAGGGGGAGGTGGTGCTCGGAGAGGACGAGGCGGCGGTAGCGACGGACGGCGCGGATGAGGTAACGGTGGCGGGGGCTGGAGATGGTGAATTTGGGGGAGAGGCGGATTGCTTGTGGGTGGGGCCACATGATTTGAATGTGAACGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057812153.1
MKDNSDVDAVGERGGGVGDGDCDGLKRRRRREVEEWRDEGEVVLGEDEAAVATDGADEVTVAGAGDGEFGGEADCLWVGPHDLNVNGKKEFEQQMEVLGRLRHPNLIGLKAYYFARDEKLLVHEFMPNGNLFWLLHAEAVKMRTMMRLTLPLANSGSTRGLVGGTLTRKAWNLFSQLMMRLPNKL

XP_057812154.1
MKDNSDVDAVGERGGGVGDGDCDGLKRRRRREVEEWRDEGEVVLGEDEAAVATDGADEVTVAGAGDGEFGGEADCLWVGPHDLNVNGKKEFEQQMEVLGRLRHPNLIGLKAYYFARDEKLLVHEFMPNGNLFWLLHEAVKMRTMMRLTLPLANSGSTRGLVGGTLTRKAWNLFSQLMMRLPNKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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