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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002533`

染色体: Chr05 坐标: 28225291-28227097 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002533`
名称	SmilChr05G002533
描述	ribulose-phosphate 3-epimerase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	28225291 - 28227097 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026325`
GeneID	`131026325`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026325`
原始查询	`LOC131026325`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribulose-phosphate 3-epimerase, chloroplastic-like
产物	ribulose-phosphate 3-epimerase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G61410` (RPE) D-ribulose-5-phosphate-3-epimerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836262] identity=88.6; qcov=0.907; evalue=7.6e-51; confidence=high
Rice	`Os03g0169100` (RPE) - identity=94.2; qcov=0.887; evalue=1.22e-53; confidence=high
GO	GO:0004750 (D-ribulose-phosphate 3-epimerase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0009052 (pentose-phosphate shunt, non-oxidative branch); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00834 (Ribul_P_3_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026325

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057812161.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057812161.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812161.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812161.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812161.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:28225322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B71
`Chr5:28225334`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	B122,B123,B130,B134,B40,B50,B57,B71,B99,C23,C4,C51,D8
`Chr5:28225338`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	B122,B123,B130,B134,B40,B50,B57,B71,B99,C23,C4,C51,D8
`Chr5:28225507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr5:28226317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr5:28226329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr5:28226337`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr5:28226337`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr5:28226348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr5:28226520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:28226524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B135,B82
`Chr5:28226541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812161.1

97 aa

Ribul_P_3_epim

PF00834 Ribul_P_3_epim 1-65 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812161.1`	Pfam	`PF00834`	Ribul_P_3_epim	Domain	1	65	1.4e-23	84.1	Ribulose-phosphate 3 epimerase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956178.1
TCAAGTTGTTATCTGACAGCCTGTTACTTGCTACTAGAAAAAAGCCGGAGTTGTCCTGAACCCCGGGACTCCATTGAGTACCATAGAGTATGTTCTTGATGTGGTTGATTTGGTATTGATTATGTCTGTAAATCCCGGGTTTGGTGGGCAAAGCTTCATAGAAAGCCAAGTAAAGAAAATAGTGGAGTTGAGAAGATTGTGCGCTGAGAAGGGAGTGAACCCATGGATTGAGGTAGATGGTGGAGTTGGTCCGAGTAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026325
ATGTCTGTAAATCCCGGGTTTGGTGGGCAAAGCTTCATAGAAAGCCAAGTAAAGAAAATAGTGGAGTTGAGAAGATTGTGCGCTGAGAAGGGAGTGAACCCATGGATTGAGGTAGATGGTGGAGTTGGTCCGAGTAATGCATACAAGGTAATTGAGGCCGGAGCCAATGCGTTGGTTGCTGGCTCTGCTGTTTTCGGAGCTCCTGATTATGCTGAAGCTATCAAAGGGATCAAAACCAGCAAAAGGCCTGTAGCAGTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812161.1
MSVNPGFGGQSFIESQVKKIVELRRLCAEKGVNPWIEVDGGVGPSNAYKVIEAGANALVAGSAVFGAPDYAEAIKGIKTSKRPVAVAIKTLHSGFLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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