当前解析结果
SmilChr01G002534| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002534 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002534 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002534 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 43343102 - 43360553 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131026335 |
|---|---|
| GeneID | 131026335 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026335 |
| 原始查询 | LOC131026335 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026335 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057812174.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057812174.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057812174.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057812174.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057812174.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:43343174 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B120 |
Chr1:43343181 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D7 |
Chr1:43343181 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr1:43343186 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,C62 |
Chr1:43343196 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B124,B32,B59,C78 |
Chr1:43343197 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,C62 |
Chr1:43343201 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B56 |
Chr1:43343204 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr1:43343206 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,C40 |
Chr1:43343222 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B14,B3,C83 |
Chr1:43343222 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B14,B3,C83 |
Chr1:43343226 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B55,C4,C72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。