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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002585`

染色体: Chr05 坐标: 29064398-29068056 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002585`
名称	SmilChr05G002585
描述	gamma-soluble NSF attachment protein
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29064398 - 29068056 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026340`
GeneID	`131026340`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026340`
原始查询	`LOC131026340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gamma-soluble NSF attachment protein
产物	gamma-soluble NSF attachment protein
Arabidopsis	`AT4G20410` (GSNAP) gamma-soluble NSF attachment protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827789] identity=74.5; qcov=1; evalue=7.7e-168; confidence=high
Rice	`Os04g0618500` - identity=72.5; qcov=1; evalue=1.46e-159; confidence=high
GO	GO:0005483 (soluble NSF attachment protein activity); GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0019905 (syntaxin binding); GO:0031201 (SNARE complex)
KEGG	-
Pfam	PF14938 (SNAP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026340

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057812180.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057812180.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057812180.1`
4	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057812180.1`
5	Midbody	Midbody	0.60000	`XP_057812180.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29064998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C33,C38,C78
`Chr5:29066387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr5:29066455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr5:29067191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:29067193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:29067204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B9,C32
`Chr5:29067860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812180.1

294 aa

147

294

SNAP

PF14938 SNAP 4-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812180.1`	Pfam	`PF14938`	SNAP	Repeat	4	250	3.2e-24	86.6	Soluble NSF attachment protein, SNAP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102247.1
ATGTAAAGGAGATTCCCGGGTCTTCACAGAAATATAAGTACAGAAAACCCGAATAACTTGACCCACCATAGGTGATTCCAGGACTCCGAATTTCGATCGGCGATGGCTACCGACCCCGACAAATTGATGGCCAAAGCAGATAAAATGACAAAACTCAGTTTGACGAGATGGAATGCTGATTGGAGGAATGCAACAGCTCTGTATGAACAGGCTGGAAATGCGTACAGGCTTGCTAGAAAGTACGATAAAGCTAAGGAAGC...

XR_009102248.1
ATGTAAAGGAGATTCCCGGGTCTTCACAGAAATATAAGTACAGAAAACCCGAATAACTTGACCCACCATAGGTGATTCCAGGACTCCGAATTTCGATCGGCGATGGCTACCGACCCCGACAAATTGATGGCCAAAGCAGATAAAATGACAAAACTCAGTTTGACGAGATGGAATGCTGATTGGAGGAATGCAACAGCTCTGTATGAACAGGCTGGAAATGCGTACAGGCTTGCTAGAAAGTACGATAAAGCTAAGGAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026340
ATGGCTACCGACCCCGACAAATTGATGGCCAAAGCAGATAAAATGACAAAACTCAGTTTGACGAGATGGAATGCTGATTGGAGGAATGCAACAGCTCTGTATGAACAGGCTGGAAATGCGTACAGGCTTGCTAGAAAGTACGATAAAGCTAAGGAAGCATTTGAAAAGGCTTCCAAGGGGCAAGAAATGCAAGCTTCGCCGTGGGATGCTGCAAAACATATGGAGTCTGCTGCAGCTCTTGCAAAGGAAGTAGGCAACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812180.1
MATDPDKLMAKADKMTKLSLTRWNADWRNATALYEQAGNAYRLARKYDKAKEAFEKASKGQEMQASPWDAAKHMESAAALAKEVGNWNEVSDFYRRASELYIECGRAQPASDALAKGARALEDALPDGAIQLYTDACTVLEEDGKEQMAFDLYRAATSVYIKLEKYTDAATFLLRLALAADKCNATHSQCKAYLSAIIVYLYAHDFEQAEKCYNDCCQVDAFMNSDQNRAASRLMSAYTDGDVEEIKRAAQSSIISNLDH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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