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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002550`

染色体: Chr01 坐标: 43605752-43610948 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002550`
名称	SmilChr01G002550
描述	PGR5-like protein 1A, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43605752 - 43610948 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026356`
GeneID	`131026356`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026356`
原始查询	`LOC131026356`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PGR5-like protein 1A, chloroplastic
产物	PGR5-like protein 1A%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G22890` (PGR5-LIKE A) PGR5-LIKE A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828388] identity=73.8; qcov=1.01; evalue=1.16e-168; confidence=high
Rice	`Os08g0526300` (OJ1191_A10.128) - identity=78.7; qcov=0.789; evalue=8.33e-148; confidence=high
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009773 (photosynthetic electron transport in photosystem I); GO:0016730 (oxidoreductase activity, acting on iron-sulfur proteins as donors)
KEGG	-
Pfam	PF30904 (PGRL1_C); PF30905 (PGRL1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026356

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057812209.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057812209.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057812209.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.60000	`XP_057812209.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43610107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B139,C10,C46,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812209.1

322 aa

161

322

PGRL1_N

PGRL1_C

PF30905 PGRL1_N 91-167 aa PF30904 PGRL1_C 195-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812209.1`	Pfam	`PF30905`	PGRL1_N	Domain	91	167	3.6e-35	120.9	PGRL1 N-terminal domain
`XP_057812209.1`	Pfam	`PF30904`	PGRL1_C	Domain	195	316	6.2e-56	188.5	PGRL1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956226.1
AGTCGTAAGAAGAAAACAACCAAAGCAGCAGATTTTCATTACCAACTCAAACAAACTCTCCCAAATTCCCCGCCACACATTCCCACTCGCCTTATCTTCCTAGCTCTTCCCTCTTCCCACTAATTTCCCACATCTTTCAAATGCACCCATTTCCCAAAACCCGCCTCCCATTCTCCTCCTTCCGCCGCCGCCGATGGCGTCAAGACTTGGCTTCAACCTAGCAAAACCCAGGCTTTTCACTGCCCAAATCAGAAAACCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026356
ATGGCGTCAAGACTTGGCTTCAACCTAGCAAAACCCAGGCTTTTCACTGCCCAAATCAGAAAACCATTCTTCTTCGCGTCTTCTTTGCCGTCTCCTGCTCCCGGAGTTCATTCGGTTCAGTTTGGTGCCAAGAAATTAACTTTCCCGCGCAGACTGGTCTTTCTTTCTCCTCAGGCCACCAGTGAGCAGCCAGGTCAGGTCCAAGGAGATGAGGTTGTTGACAGCAATGTCTTGCCTTATTGCAGCTTAGAGAAACAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812209.1
MASRLGFNLAKPRLFTAQIRKPFFFASSLPSPAPGVHSVQFGAKKLTFPRRLVFLSPQATSEQPGQVQGDEVVDSNVLPYCSLEKQKKSIGEMEQEFLQALQAFYYEGKSIMSNEEFDNLKEELMWEGSSVVMLSGDEQRFLEASMAYVSGNPIMSDEEYDKLKRQLKIDGSEIVVEGPRCSLRSKKVYSDLSVDYLKMFLLNVPAAVVALGLFFFLDDLTGFEITYLLELPEPFSFIFTWFAALPLILYLSFTFTNIII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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