当前解析结果
SmilChr05G002611| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002611 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002611 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002611 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 29395540 - 29396278 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131026362 |
|---|---|
| GeneID | 131026362 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026362 |
| 原始查询 | LOC131026362 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026362 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057812212.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057812212.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057812212.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057812212.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057812212.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:29395629 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 37 | A20,A24,A3,A5,B108,B125,B126,B138,B22,B24,B42,B49,B51,B52,B54,B57,B63,B81,B87,B88,B90,B92,C22,C28,C30,C34,C35,C40,C54,C55,C61,C73,C85,D1,D4,D7,D9 |
Chr5:29395660 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D1 |
Chr5:29395771 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B134,B58,C11,C52 |
Chr5:29395793 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 81 | A1,A13,A16,A21,A24,A3,A7,B10,B102,B105,B109,B111,B115,B12,B120,B125,B127,B128,B129,B134,B135,B136,B139,B140,B16,B17,B19,B21,B22,B27,B28,B3,B32,B38,B40,B42,B43,B47,B48,B51,B53,B56,B59,B61,B66,B70,B73,B75,B77,B81,B83,B96,B98,C14,C21,C22,C23,C25,C28,C29,C33,C38,C4,C41,C45,C49,C5,C50,C55,C63,C64,C66,C68,C74,C78,C85,C87,D10,D5,D8,D9 |
Chr5:29395816 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr5:29395833 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B102,B123,C16 |
Chr5:29395855 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 28 | A18,B1,B108,B112,B117,B118,B13,B137,B2,B37,B51,B59,B78,B80,B84,B89,B9,C20,C23,C25,C26,C31,C32,C50,C51,C59,C68,C76 |
Chr5:29395880 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 30 | A18,B1,B102,B108,B112,B117,B118,B13,B137,B2,B37,B51,B59,B78,B80,B84,B89,B9,C20,C23,C25,C26,C31,C32,C50,C51,C59,C68,C76,D4 |
Chr5:29395896 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B134 |
Chr5:29395898 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B127,B23,B32,B64 |
Chr5:29395918 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B13,D1 |
Chr5:29395950 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 23 | A2,A23,B11,B113,B121,B138,B26,B29,B34,B41,B42,B43,B44,B5,B6,B81,B83,B97,C13,C24,C49,C59,D2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。