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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002535`

染色体: Chr01 坐标: 43374382-43379875 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002535`
名称	SmilChr01G002535
描述	nudix hydrolase 14, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43374382 - 43379875 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026367`
GeneID	`131026367`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026367`
原始查询	`LOC131026367`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 14, chloroplastic
产物	nudix hydrolase 14%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G11980` (NUDX14) nudix hydrolase homolog 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826805] identity=60.1; qcov=1.02; evalue=4.54e-123; confidence=high
Rice	`Os06g0129700` (P0538C01.23) - identity=59.4; qcov=0.969; evalue=1.91e-115; confidence=high
GO	GO:0006753 (nucleoside phosphate metabolic process); GO:0019693 (ribose phosphate metabolic process); GO:0080041 (ADP-ribose pyrophosphatase activity); GO:0080042 (ADP-glucose pyrophosphatase activity)
KEGG	smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00293 (NUDIX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026367

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057812219.1`
2	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057812226.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057812219.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057812226.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057812219.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43374437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B122,B89,D3,D6
`Chr1:43374439`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A15,A16,A18,B106,B111,B114,B118,B131,B135,B3,B37,B57,B60,B62,B7,B72,B78,B86,B98,C1,C17,C18,C2,C21,C27,C45,C49,C51,C58,C7,C75,D10,D9
`Chr1:43374470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B56,B71,B74,B96
`Chr1:43374506`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B101,B103,B137,B79,B85,C28,C39
`Chr1:43374509`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B101,B103,B137,B79,B85,C28,C39
`Chr1:43374577`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A18,A6,B101,B103,B130,B137,B28,B44,B79,B85,C28,C39,D1
`Chr1:43374580`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	13	A18,A6,B101,B103,B130,B137,B28,B44,B79,B85,C28,C39,D1
`Chr1:43374619`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A6,B130,B28,B44,B63,B79,B85,C28,C37,D1
`Chr1:43374640`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A6,B103,B130,B28,B44,B63,B74,B79,B85,C28,C37,D1
`Chr1:43374643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A6,B103,B130,B28,B44,B63,B74,B79,B85,C28,C37,D1
`Chr1:43374645`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A6,B101,B103,B130,B28,B44,B63,B74,B79,B85,C28,C37,D1
`Chr1:43375747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B54,B78,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812219.1

321 aa

160

321

NUDIX

PF00293 NUDIX 157-296 aa

XP_057812226.1

295 aa

148

295

NUDIX

PF00293 NUDIX 131-270 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812219.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	157	296	4.7e-13	50.0	NUDIX domain
`XP_057812226.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	131	270	3.9e-13	50.3	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956236.1
TATTAGGTGAAAATTCGTCGACGAGGCATTAACTAAATTGTTGTGAAAATGAGAGCACTTTCGCTTCTTCCCGCACAGCTTGTGCTCACAGTTTCGAGGCGCGTTCTCTCCACCAAAGGCTTCAACACATCACTCACTGAGTCAACTCGTTTTCCCACTCGACCTCTTCATAGAGCTACTCGAATTCGGGCTTTAAAAATGACCACCGAGTCGACCTCGCCAGAACTCACTCATGCGATCACCCTCCCGGCTCAACTCGA...

XM_057956243.1
TATTAGGTGAAAATTCGTCGACGAGGCATTAACTAAATTGTTGTGAAAATGAGAGCACTTTCGCTTCTTCCCGCACAGCTTGTGCTCACAGTTTCGAGGCGCGTTCTCTCCACCAAAGGCTTCAACACATCACTCACTGAGTCAACTCGTTTTCCCACTCGACCTCTTCATAGAGCTACTCGAATTCGGGCTTTAAAAATGACCACCGAGTCGACCTCGCCAGAACTCACTCATGCGATCACCCTCCCGGCTCAACTCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026367
ATGAGAGCACTTTCGCTTCTTCCCGCACAGCTTGTGCTCACAGTTTCGAGGCGCGTTCTCTCCACCAAAGGCTTCAACACATCACTCACTGAGTCAACTCGTTTTCCCACTCGACCTCTTCATAGAGCTACTCGAATTCGGGCTTTAAAAATGACCACCGAGTCGACCTCGCCAGAACTCACTCATGCGATCACCCTCCCGGCTCAACTCGACCAATGCGTCACCGTTGTAGCCGCCGCCGGTGTCTCAGAGTCTGATTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057812219.1
MRALSLLPAQLVLTVSRRVLSTKGFNTSLTESTRFPTRPLHRATRIRALKMTTESTSPELTHAITLPAQLDQCVTVVAAAGVSESDFRNAIECSLFKQWLKNIQTENGLLSNGDMSLRQVIIQGIDMFGKRVGFLKFKADVVHKQTGNKVPGIVFARGPAVAVLILLDSDGETYAVLTEQVRVPVGKLMLELPAGMLDDDKGDICGTAVREVEEETGLHLNMDDLVDLTAFLDPSTGNQVFPSPGGCDEGIGLFLYRGSV...

XP_057812226.1
MRALSLLPAQLVLTVSRRVLSTKGFNTSLTESTRFPTRPLHRATRIRALKMTTESTSPELTHAITLPAQLDQCVTVVAAAGVSESDFRNAIECSLFKQWLKNIQTENGLLSNGDMSLRQVIIQVPGIVFARGPAVAVLILLDSDGETYAVLTEQVRVPVGKLMLELPAGMLDDDKGDICGTAVREVEEETGLHLNMDDLVDLTAFLDPSTGNQVFPSPGGCDEGIGLFLYRGSVDKDIIRQLQGKETGLRDHGELIQVRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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