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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002625`

染色体: Chr05 坐标: 29593828-29601752 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002625`
名称	SmilChr05G002625
描述	twinkle homolog protein, chloroplastic/mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29593828 - 29601752 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026375`
GeneID	`131026375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026375`
原始查询	`LOC131026375`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	twinkle homolog protein, chloroplastic/mitochondrial
产物	twinkle homolog protein%2C chloroplastic/mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G30680` (AT1G30680) toprim domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839948] identity=66.9; qcov=0.872; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0671700` - identity=82.2; qcov=0.28; evalue=6.57e-124; confidence=weak
GO	GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006260 (DNA replication); GO:0043139 (5'-3' DNA helicase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01751 (Toprim); PF03796 (DnaB_C); PF13155 (Toprim_2); PF13662 (Toprim_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057812225.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057812225.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057812225.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812225.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812225.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29594184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:29594614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr5:29594683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C50
`Chr5:29595179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:29599459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:29599789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:29600344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B137,B60
`Chr5:29601338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812225.1

721 aa

360

721

Toprim_4

Toprim

Toprim_2

DnaB_C

PF13662 Toprim_4 295-380 aa PF01751 Toprim 296-376 aa PF13155 Toprim_2 297-395 aa PF03796 DnaB_C 450-692 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812225.1`	Pfam	`PF13662`	Toprim_4	Domain	295	380	1.3e-14	54.9	Toprim domain
`XP_057812225.1`	Pfam	`PF01751`	Toprim	Family	296	376	2.1e-09	38.1	Toprim domain
`XP_057812225.1`	Pfam	`PF13155`	Toprim_2	Family	297	395	9.5e-08	33.0	Toprim-like
`XP_057812225.1`	Pfam	`PF03796`	DnaB_C	Domain	450	692	3.7e-09	37.1	DnaB-like helicase C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956242.1
TTTTTAATACTATATTTCTCAAAAACATTCGGAAAATAGTGCTGCTCCTTAAACCCTTCCTGCTTCCCTCCCGCCTTCCATGGCAGCTGAAAATTTATCTTCTCTCTCTTGCTAACAACTATTCTTGAGAGATAAACTATGCTTTTCCTACCGCCTCGTAAACTTTTGTTGAACCCGTCTTCGAAGAGTAGCAGAATAATTGTCATGGGTTCCAAGAATTTTCTGCTCCTGAAATCGTCGGCTGCTCCGGCTACTTACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026375
ATGCTTTTCCTACCGCCTCGTAAACTTTTGTTGAACCCGTCTTCGAAGAGTAGCAGAATAATTGTCATGGGTTCCAAGAATTTTCTGCTCCTGAAATCGTCGGCTGCTCCGGCTACTTACGCCTGCTTACATTCGCTCCATGATTGTTCTTCTTCTCCGAGAACACTTCTTTTTGACTCCTACAATCGGAAAAGCTCGAGGCTTTTTGCTTCTCCGAAGCATTTGCAGCTAAGTTATCAGAGGGCCTCTGGCTACAGTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812225.1
MLFLPPRKLLLNPSSKSSRIIVMGSKNFLLLKSSAAPATYACLHSLHDCSSSPRTLLFDSYNRKSSRLFASPKHLQLSYQRASGYSYTPYSAMPIPRPISGVNVETLEKQFVDDKKMMILRQKLQEIGIDGSSCMPGQYNGLVCPNCKGGGSNEKSLSLHVTEDGGAAVWTCFRAKCGWKGATRAFAGVKXTYSTMSKTKIKQPIRKITEESLGLEPLCSELLAYFAERMISGETLRRNAVMQKRTGDQIAIAFTYQRNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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