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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002655`

染色体: Chr05 坐标: 30058005-30061354 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002655`
名称	SmilChr05G002655
描述	tetrahydroberberine oxidase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	30058005 - 30061354 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026376`
GeneID	`131026376`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026376`
原始查询	`LOC131026376`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetrahydroberberine oxidase-like
产物	tetrahydroberberine oxidase-like
Arabidopsis	`AT4G20820` (AT4G20820) FAD-binding Berberine family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827830] identity=47; qcov=0.978; evalue=4.09e-174; confidence=high
Rice	`Os06g0548100` - identity=46.3; qcov=0.978; evalue=5.54e-158; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF08031 (BBE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026376

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057812227.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057812227.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812227.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812227.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812227.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:30058214`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr5:30058214`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B108
`Chr5:30058234`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	139	A10,A14,A16,A19,A21,A23,A24,A25,A4,A5,A7,A9,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B119,B120,B122,B123,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B27,B31,B34,B35,B36,B4,B40,B41,B45,B48,B52,B53,B58,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B66,B68,B70,B71,B72,B73,B75,B8,B81,B82,B84,B85,B88,B91,B93,B95,B98,B99,C1,C10,C14,C15,C17,C18,C19,C22,C24,C25,C27,C28,C29,C3,C30,C37,C39,C40,C41,C43,C44,C47,C48,C49,C5,C51,C53,C56,C57,C58,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C7,C70,C71,C77,C80,C82,C9,D1,D11,D2,D3,D5
`Chr5:30058248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B104,B134,B21
`Chr5:30058264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr5:30058331`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B13
`Chr5:30058331`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B13
`Chr5:30058380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,C1,C51,C65,C80
`Chr5:30058390`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A2,B131,B20,B35,B40,B75,C58,C62,C71,C82,D11
`Chr5:30058458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:30058507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B106,B129,B139,B3,C17,C36
`Chr5:30058508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B9,C5,D3,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812227.1

552 aa

276

552

FAD_binding_4

BBE

PF01565 FAD_binding_4 93-229 aa PF08031 BBE 487-545 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812227.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	93	229	6e-25	88.3	FAD binding domain
`XP_057812227.1`	Pfam	`PF08031`	BBE	Domain	487	545	2.5e-21	76.1	Berberine and berberine like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956244.1
ATTAGCAGGGTGTATAAGTAATAGATATTGGACGAATTCATCCAGATTAATGCAAAGCTAGCTAAATTAATTGCGTGAATACAAAATACGTAAGAAAACGAAAAATTTCCAGAAATTAACAATATTTCAAACGTGTTGATTTCATTCAAACCTGGGCAGACCAATTATTTTACCGTTTGAATTTTCCCTGTCAAATAGAACGTGAATGAGTCTAGCTAGCTTCATTCCACAAAGAAATCATCTCTCAACTATGAAGACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026376
ATGAGTCTAGCTAGCTTCATTCCACAAAGAAATCATCTCTCAACTATGAAGACTCCAAGCATTTTCACTTTCACTTTCACTTTGATTCTTCTTGCCATCATTTCGTGTTCACGAGCATCATCTTGTGCAGATAACTTTCTTGAATGTCTATCCAAAGAATTCAACAACTACTCTTCCATTTCCAACAACATCTACACCCCAATCAACTCTTCTTATTCATCTATTTTGCCACTAACCATCCGGAATCTGAGATTCGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812227.1
MSLASFIPQRNHLSTMKTPSIFTFTFTLILLAIISCSRASSCADNFLECLSKEFNNYSSISNNIYTPINSSYSSILPLTIRNLRFASDPTSSPLIIITPRHESQIPPLIHCAQERGLQIRTRSGGHDFEGLSYRAQLPFIIIDLINLSDITVDVDRKTAWVGIGATIGSLYYKIAEGSPILGFPAGLCPTVGLGGYISGGGYGTMMRKYGLAADNVIDAKIVDAKGRILDRKSMGEDLFWAIRGGGGATFGVIVAWKVQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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