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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002686`

染色体: Chr05 坐标: 30490007-30495337 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002686`
名称	SmilChr05G002686
描述	cationic amino acid transporter 8, vacuolar
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	30490007 - 30495337 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026426`
GeneID	`131026426`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026426`
原始查询	`LOC131026426`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cationic amino acid transporter 8, vacuolar
产物	cationic amino acid transporter 8%2C vacuolar
Arabidopsis	`AT1G17120` (CAT8) cationic amino acid transporter 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838282] identity=66.5; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0209800` (OsCAT1) - identity=57.7; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006865 (amino acid transport); GO:0015171 (amino acid transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00324 (AA_permease); PF13520 (AA_permease_2); PF13906 (AA_permease_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026426

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057812274.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057812274.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057812274.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812274.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812274.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:30490324`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr5:30490324`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr5:30490353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C16
`Chr5:30490369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B113,B120,B122,B76
`Chr5:30490382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B113,B120,B122,B76
`Chr5:30490390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B120,B122,B76
`Chr5:30490423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr5:30490431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr5:30490475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	110	A1,A15,A18,A20,A22,A23,A24,A25,A5,A8,A9,B101,B104,B106,B107,B111,B113,B118,B12,B122,B123,B124,B131,B132,B134,B136,B138,B140,B18,B19,B20,B22,B23,B24,B27,B28,B29,B3,B39,B40,B41,B46,B47,B49,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B64,B66,B69,B70,B73,B74,B75,B78,B79,B8,B81,B82,B85,B86,B87,B93,B97,B98,B99,C10,C11,C12,C14,C17,C19,C2,C23,C25,C27,C28,C29,C3,C36,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C46,C49,C50,C6,C62,C65,C66,C68,C7,C70,C8,C80,C85,C86,C87,D2,D4,D7,D8,D9
`Chr5:30490494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr5:30490511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B48,B8,C64,D7
`Chr5:30490517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812274.1

592 aa

296

592

AA_permease_2

AA_permease

AA_permease_C

PF13520 AA_permease_2 91-494 aa PF00324 AA_permease 96-492 aa PF13906 AA_permease_C 529-578 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812274.1`	Pfam	`PF13520`	AA_permease_2	Family	91	494	3.7e-51	175.1	Amino acid permease
`XP_057812274.1`	Pfam	`PF00324`	AA_permease	Domain	96	492	6.7e-29	101.6	Amino acid permease
`XP_057812274.1`	Pfam	`PF13906`	AA_permease_C	Domain	529	578	2.6e-13	50.6	C-terminus of AA_permease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956291.1
CGACATAACAAATAAACAAGTCACAGTTGTATTAATGTCAGCTGAAAATATTAGGTACACGAGACTTCTCTTCATAACTCAATTCTACTGAATTTCGAATCTCGACTGATGCAAATCTGGAATCCGTTTCCAAATTCGCCAATCACTCCATTACCTTTCTGCCTAAAAATCTTCATTGCTCTTCATAAATGGGATACACTAACACCAATGAAAGTCAAAATCTGGACGACCTCACATCCCCCCTCACCATGAATCCCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026426
ATGGGATACACTAACACCAATGAAAGTCAAAATCTGGACGACCTCACATCCCCCCTCACCATGAATCCCTCCGACGCCACCGGAAAATCCTACTGGCGATTCAGCAAGCAGGACTTCTTCCCCGAACCCTCCTTCCAGAACTCCGGCACCTACCTCGCCGCCCTCACCAAGACCCCCCTCCGCCTCAGAGACCGCCTCCTCGGCCGCACCTCCGAGGCCGACGAGCTCGTCGAGGCCAAGAAACAGTCCGAGAATGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812274.1
MGYTNTNESQNLDDLTSPLTMNPSDATGKSYWRFSKQDFFPEPSFQNSGTYLAALTKTPLRLRDRLLGRTSEADELVEAKKQSENEMKKCLTWWDLIWLGFGSVVGSGIFSITGLETRDHAGPAIVLAYAVSGLSALLSVFCYTEFAVEIPVAGGSFSFLRIELGDFIAFIAAGNILLEGLVGAAGLGRSWSSYLASLFSSNPDFLRFRINSLAEGFNVLDPLAVLILLVVNGIAMTGTKHSSVLNWVSSIFSAAVIVFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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