当前解析结果
SmilChr05G002689| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002689 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002689 |
| 描述 | gibberellin 2-beta-dioxygenase 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 30607482 - 30609957 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131026427 |
|---|---|
| GeneID | 131026427 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026427 |
| 原始查询 | LOC131026427 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | gibberellin 2-beta-dioxygenase 1-like |
| 产物 | gibberellin 2-beta-dioxygenase 1-like |
| Arabidopsis | AT1G30040 (GA2OX2)gibberellin 2-oxidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839883] identity=60.1; qcov=0.929; evalue=4.76e-136; confidence=high |
| Rice | Os01g0757200 (GA2OX3)- identity=56.6; qcov=1; evalue=1.35e-126; confidence=high |
| GO | GO:0009416 (response to light stimulus); GO:0045487 (gibberellin catabolic process); GO:0052634 (GO:0052634) |
| KEGG | smil00904 (Diterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026427 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057812275.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057812275.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057812275.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057812275.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057812275.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057812275.1PF14226
DIOX_N 25-111 aa
PF03171
2OG-FeII_Oxy 171-270 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057812275.1 |
Pfam | PF14226 |
DIOX_N | Family | 25 | 111 | 1e-16 | 62.3 | non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal |
XP_057812275.1 |
Pfam | PF03171 |
2OG-FeII_Oxy | Domain | 171 | 270 | 1.9e-31 | 109.1 | 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。