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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002714`

染色体: Chr05 坐标: 31251947-31255757 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002714`
名称	SmilChr05G002714
描述	pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31251947 - 31255757 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026448`
GeneID	`131026448`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026448`
原始查询	`LOC131026448`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta-like
产物	pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta-like
Arabidopsis	`AT2G34590` (AT2G34590) Transketolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818024] identity=78.6; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0616900` - identity=87.3; qcov=0.841; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004739 (pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) activity); GO:0006086 (pyruvate decarboxylation to acetyl-CoA)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00020 (Citrate cycle (TCA cycle) - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00785 (Lipoic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02779 (Transket_pyr); PF02780 (Transketolase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026448

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057812300.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057812300.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812300.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812300.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812300.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31252325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B25
`Chr5:31252610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr5:31252778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr5:31252898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr5:31253033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C75,C82
`Chr5:31253265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B122,B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812300.1

395 aa

198

395

Transket_pyr

Transketolase_C

PF02779 Transket_pyr 78-249 aa PF02780 Transketolase_C 265-386 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812300.1`	Pfam	`PF02779`	Transket_pyr	Domain	78	249	7.6e-43	146.9	Transketolase, pyrimidine binding domain
`XP_057812300.1`	Pfam	`PF02780`	Transketolase_C	Domain	265	386	5.8e-37	127.1	Transketolase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956317.1
AGGCAAATACTGTGGGCAGTTCGTTCAAACATATCGTAGAAAAGAAAAAAAGGGAAGCAAGAAAATACAGATGGATCGTCTTTGGTATCATCGCCATTGCTATTTCTACTGCATCTTTGCTTCAAATCTGGCCCCCCTCTTTGCATTTGTATCTCCGCCTCCTCCCCTTTCTCTCTCTCTCCTCTCTCCCACTATATAACCACTTTTTCCGCCACACCACCCCACTCTTCTGTTTCTCTCTACGCTCGCAACTTCAAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026448
ATGGCAGCTTCATTTGGAGTTTCATCGGCCGCAGTTGCCCTTGCGGATCACGCCGTCAAATCTTCTGCTTTCCCTCTTCCTTCTCTTACAGTAATCAGATCTGAGGCGAGGCCGATCTCGGGTCGGGTTAATAGATCTCGCAAGGCTGGGAAAATCTCTACTCACGCAGTTGCGGCACAGACTGAAAATCCTGCCTCAGCGGCTTCCAAACCAGGGCATGAAGTGCTGCTGTTTGAAGCCCTTAGAGAAGGACTGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812300.1
MAASFGVSSAAVALADHAVKSSAFPLPSLTVIRSEARPISGRVNRSRKAGKISTHAVAAQTENPASAASKPGHEVLLFEALREGLEEEMERDPRVCIFGEDVGHYGGSYKVSKGLADKYGDLRVLDTPIAENSFTGMAVGAAMTGLRPVVEGMNMGFLLLAFNQISDNCGMLHYTSGGQFTIPTVIRGPGGVGRQLGAEHSQRLESYFQSIPGIQMVACSTPYNAKGLMKAAIRSENPVVLFEHVLLYNLKERIPDEEYV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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