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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002739`

染色体: Chr05 坐标: 31570181-31571022 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002739`
名称	SmilChr05G002739
描述	late embryogenesis abundant protein At1g64065-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31570181 - 31571022 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026472`
GeneID	`131026472`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026472`
原始查询	`LOC131026472`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryogenesis abundant protein At1g64065-like
产物	late embryogenesis abundant protein At1g64065-like
Arabidopsis	`AT2G46150` (AT2G46150) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819222] identity=39.5; qcov=0.996; evalue=7.93e-49; confidence=medium
Rice	`Os01g0736500` - identity=36.2; qcov=0.777; evalue=1.74e-29; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026472

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057812331.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812331.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812331.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812331.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812331.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31570304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B138,C32,C39
`Chr5:31570321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr5:31570656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D11
`Chr5:31570665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A24,B46,D3
`Chr5:31570696`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A15,B100,B107,B119,B122,B134,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812331.1

224 aa

112

224

LEA_2

PF03168 LEA_2 104-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812331.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	104	203	2.7e-09	38.1	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956348.1
ATGGCAAAGAAAAAACAAAGCAAAACTCCAATAATATAAATTAAGAATCTACATAAAAAAGCAAACTTGGCAACCAAATTTAATTACTTGATCAGCCATGGCCGAGAGAAGAGAACAAGAGAAGCCCCTCGCCCCGGCCACCCCCGCAATCGTCTTCGTCGAAAAGCTCACCCCCTTCCCGGCGGCAGAGTTCATATCGCGCCGCCGCAAGCGATGCCTCAAGTGCTGCGGCTGCTCCGCCGCGCTGCTCCTAGTCATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026472
ATGGCCGAGAGAAGAGAACAAGAGAAGCCCCTCGCCCCGGCCACCCCCGCAATCGTCTTCGTCGAAAAGCTCACCCCCTTCCCGGCGGCAGAGTTCATATCGCGCCGCCGCAAGCGATGCCTCAAGTGCTGCGGCTGCTCCGCCGCGCTGCTCCTAGTCATCGCCGTCACAACACTCGCGCTCATGCTCACAGTCTTCCACGTGAAGGATCCAGCGATCAAGCTGAACTCGGTGAACATCCACGGCTTCGATAAACTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812331.1
MAERREQEKPLAPATPAIVFVEKLTPFPAAEFISRRRKRCLKCCGCSAALLLVIAVTTLALMLTVFHVKDPAIKLNSVNIHGFDKLSNNTNALAGFNLTLVAGISIKNPNAASFKFDEATAGVHYGGALVGEARAPAGEAGPRRKRRMDVVVDIMVDRLVGVSRFESDYAAGILPLSAYARVKGVVKITDVIKRSFVVKINCSFSVDFRSQVIRDRSCMRDLSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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