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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002746`

染色体: Chr05 坐标: 31638202-31639687 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002746`
名称	SmilChr05G002746
描述	uncharacterized SmilChr05G002746
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31638202 - 31639687 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026477`
GeneID	`131026477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026477`
原始查询	`LOC131026477`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger MYM-type-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826552]; symbol=AT4G09660; hit=AT4G09660; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	zinc finger MYM-type-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826552]; symbol=AT4G09660; hit=AT4G09660; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G09660` (AT4G09660) zinc finger MYM-type-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826552] identity=42; qcov=0.636; evalue=5.22e-29; confidence=medium
Rice	`Os09g0356100` - identity=37.7; qcov=0.471; evalue=2.98e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812334.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057812334.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812334.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812334.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812334.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31638344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr5:31638455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B21,B91
`Chr5:31638461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B78,C33,C61
`Chr5:31638474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B10,B106,B21,B91
`Chr5:31638490`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr5:31638490`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr5:31638514`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A13,A19,A23,A9,B10,B102,B112,B121,B27,B34,B41,B6,B61,B74,B82,B86,C10,C11,C22,C33,C36,C38,C51,C69,C71,C74,D4,D9
`Chr5:31638608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr5:31638611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B128,B136,B26,B45
`Chr5:31638617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr5:31638623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,D11
`Chr5:31638664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812334.1

225 aa

112

225

DUF4371

PF14291 DUF4371 131-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812334.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	131	173	4.8e-11	43.4	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956351.1
TCAAACGAAATTTAGAATAAACCCCCAAACCCTTTCTATCATACGAAGCCTCTGCCTGTGCTGAAACAGGTGCCGCGGCGCCAGCCTTGCGCCACCACCACCTGCCGCTCGCGCCACCACCGTCGGCCGTCGCACCACCGGGTCCATCACCGTCGGCCGTTGCGCCACATCCCCTGAATTTGTATCAGAGACACCGAGAGAGGAAATGAAACGTTTTTTTTCTAAAAAACGTAGAGGTGAATCTTCAAGTCGTTCAATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026477
ATGAAACGTTTTTTTTCTAAAAAACGTAGAGGTGAATCTTCAAGTCGTTCAATTACACCTTTTATTGGAGCAAATGTAGAAGTTGAAGAGAATGTGGAAACAGAAACAAATTTTAATGAAGATGTTCGTGATCCGGGATTAAGGAAACCAATTGATGAGTTTGATATTGCTATTCGAGATCAAGTACGTAGAGAATATTGGTCTATGGGGCCTTGTCAAGTAGTTGGACATACATATCCAAAGACTGAATTCGGCACTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812334.1
MKRFFSKKRRGESSSRSITPFIGANVEVEENVETETNFNEDVRDPGLRKPIDEFDIAIRDQVRREYWSMGPCQVVGHTYPKTEFGTQLRSFQDVWYQKFVWLEYSVAKDACFCFWCYLFKPQDKASRYRADAFTKTGFSNWKKALDKFAEHVGNADSCHNNARMQIEAFKDQKLAPIYLDAWHVLIQEILSPNSTLINSCVLLLGILKTSPQVIVYVCHNNSVIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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