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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000006`

染色体: Chr05 坐标: 24672-28103 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000006`
名称	SmilChr05G000006
描述	uncharacterized SmilChr05G000006
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24672 - 28103 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026494`
GeneID	`131026494`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026494`
原始查询	`LOC131026494`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829539]; symbol=AT4G33940; hit=AT4G33940; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829539]; symbol=AT4G33940; hit=AT4G33940; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G33940` (AT4G33940) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829539] identity=42.2; qcov=0.905; evalue=8.75e-72; confidence=medium
Rice	`Os03g0839000` (OSJNBa0042I09.10) - identity=36.3; qcov=0.622; evalue=1.25e-35; confidence=medium
GO	GO:0046872 (metal ion binding); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026494

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057812343.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057812343.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057812343.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057812343.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812343.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,C12,C83,C87
`Chr5:24918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B33,C2
`Chr5:25078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C20,C79
`Chr5:25105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B136,B30,B60,C75
`Chr5:26984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B10,B31,B55
`Chr5:27529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C83
`Chr5:27575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812343.1

275 aa

138

275

zf-C3HC4

PF00097 zf-C3HC4 93-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812343.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	93	135	1.2e-06	29.0	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956360.1
AACTTGGGTGGCTGCCTACATAAGATTAAATGCGTCCAAAATTAGGCGATTTTCTCCAAAGGAAGCTTCGGGTTCGTCACGCCCAATGAATTGATCACGTTCAATTCATGATCATATCATATCAAAATAAATTCCCAAATGATAAATTGAAAATCTTGAGCTCTCTCCTTTCCGGTACCCGAGAACCGAATCCGAATATGAATCCGAACCCGGAACCTATCTACGATGATATCGGCGGAGAATCTCCGGTCACGGCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026494
ATGATCATATCATATCAAAATAAATTCCCAAATGATAAATTGAAAATCTTGAGCTCTCTCCTTTCCGGTACCCGAGAACCGAATCCGAATATGAATCCGAACCCGGAACCTATCTACGATGATATCGGCGGAGAATCTCCGGTCACGGCGGCGTCTTCCTCCGGCGAGAGAGAAACAATTTCGGGAGCTGGCGATGATGAGAGTAATGAGGCGTCTACATCGGATGAGCGAGAGAGGAAGCTGGCAACAATGGAGAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812343.1
MIISYQNKFPNDKLKILSSLLSGTREPNPNMNPNPEPIYDDIGGESPVTAASSSGERETISGAGDDESNEASTSDERERKLATMEKPPSDDVCPICFGNFVVPCRSPCGHWYCGSCILQYWNFSAALQPCKCPMCSQRITKLIPEASLYHRRQSEISKVLQNVGDYNRLFVGGVSGFMLKFLAIPLYIKRMFREMLNPDRPGVYLHEMRIIAMLLGIIYSFVPFDFLRIGRANIIDLFDYSAFALSFTLYLVGLYLRWKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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