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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002556`

染色体: Chr01 坐标: 43686050-43690878 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002556`
名称	SmilChr01G002556
描述	eukaryotic translation initiation factor 6-2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43686050 - 43690878 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026499`
GeneID	`131026499`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026499`
原始查询	`LOC131026499`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 6-2-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 6-2-like
Arabidopsis	`AT3G55620` (eIF6A) Translation initiation factor IF6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824728] identity=81.8; qcov=0.978; evalue=2.4e-141; confidence=high
Rice	`Os07g0639800` (eIF-6) - identity=84.4; qcov=0.978; evalue=1.99e-143; confidence=high
GO	GO:0000054 (ribosomal subunit export from nucleus); GO:0000460 (maturation of 5.8S rRNA); GO:0000470 (maturation of LSU-rRNA); GO:0005730 (nucleolus); GO:0005829 (cytosol); GO:0030687 (preribosome, large subunit precursor); GO:0042256 (cytosolic ribosome assembly); GO:0043023 (ribosomal large subunit binding); GO:1902626 (assembly of large subunit precursor of preribosome)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01912 (eIF-6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026499

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812359.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057812359.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057812359.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812359.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812359.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43686273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B74
`Chr1:43686386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B94,C33,C46
`Chr1:43686418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:43686420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C74
`Chr1:43686870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:43686881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:43686884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,B99
`Chr1:43686893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:43686942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:43688066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:43688164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B17,C58,D3
`Chr1:43688832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812359.1

230 aa

115

230

eIF-6

PF01912 eIF-6 3-221 aa

XP_057812365.1

230 aa

115

230

eIF-6

PF01912 eIF-6 3-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812359.1`	Pfam	`PF01912`	eIF-6	Domain	3	221	1.3e-89	299.9	eIF-6 family
`XP_057812365.1`	Pfam	`PF01912`	eIF-6	Domain	3	221	1.3e-89	299.9	eIF-6 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956382.1
GCTTTTCTCAAGTTTCAAACTGCCGTCTGGAGACAAAGGCCGCGTTCAGGCCTTCTTCTGCCTTCTTCTGCGGCTTCTACGTTTAGCCGACATCCCACCGGCCACCGGCGCTCCTGTGCTCAGCCTTCTTCTGTGGCTTCTGCTTCTGCGTTCAGCCCGGCAGCTGCCTCCCAGTCCCAGCCGCCGGCCACACCAGCACCTCCCGCACGCCGGCCACACCAGCACGGCGACGGCGTGTCTCCGGCGGCCTGAAGATTTGA...

XM_057956376.1
TTGGTGCAATAGATAAGATCTTACCCTTTCTTTCAAAGGGCAAGGGTTCAAATCCTCTTGCCAACATTCTAAAATTTCGACTTTTTTTAATTTCATAACCGGTTCGGAAATTTCGACTTTTTTTAATTTCATAACCGGTTCGGTTACCGGTTAGCAAACTTCTCCTTATTCGATTCCGGTTAACCGGTAAACCCGAACCGAACCAATTATCAGCCCTATTTTTAATTATAAAATAGTCTTGACCCGTGCATGGCATGGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026499
ATGGCAACAAGATTGCAGTATGAGAATAATTGTGATATTGGGGTTTTCTCCAAGCTTACCAATGCATATTGTCTGGTTGCGATTGGGGGTTCGGAGAACTTCTACAGCACATTTGAGGCTGAGTTGGCTGGTGTAATTCCTGTGGTCAAAGCCTCCATTGCTGGTACTAGAATCGTCGGACGCCTATGTGCTGGAAATAAGAATGGTTTGCTTTTGCCTCACAATACTACGGATCAAGAGCTTCAACACTTAAGGAACAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057812359.1
MATRLQYENNCDIGVFSKLTNAYCLVAIGGSENFYSTFEAELAGVIPVVKASIAGTRIVGRLCAGNKNGLLLPHNTTDQELQHLRNSLPDSVAVQRIEERLNSLGNCISCNDHVALSHPYLAKETEELIADVLGVEVFRQTVAGDVLVGSYCAFSNRGGLVHPHTSIEDLDELSTLLQVPLVAGTVNCGSDVIGAGVIVNDWIAFCGSDTTATELSVIESVFKLRYHFFE

XP_057812365.1
MATRLQYENNCDIGVFSKLTNAYCLVAIGGSENFYSTFEAELAGVIPVVKASIAGTRIVGRLCAGNKNGLLLPHNTTDQELQHLRNSLPDSVAVQRIEERLNSLGNCISCNDHVALSHPYLAKETEELIADVLGVEVFRQTVAGDVLVGSYCAFSNRGGLVHPHTSIEDLDELSTLLQVPLVAGTVNCGSDVIGAGVIVNDWIAFCGSDTTATELSVIESVFKLRYHFFE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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