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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000024`

染色体: Chr05 坐标: 117600-121064 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000024`
名称	SmilChr05G000024
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	117600 - 121064 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026510`
GeneID	`131026510`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026510`
原始查询	`LOC131026510`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=26.5; qcov=0.97; evalue=6.63e-31; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=27; qcov=0.784; evalue=7.93e-36; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026510

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057812369.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057812369.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812369.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812369.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812369.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:118062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C79
`Chr5:118066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:118073`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A10,B114,B122,B135,B25,B47,B58,B83,C34,C35,C36,C50,C77,C84,C85,D11,D9
`Chr5:118075`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A10,B114,B122,B135,B25,B47,B58,B83,C34,C35,C36,C50,C77,C84,C85,D11,D9
`Chr5:118090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B35,C7
`Chr5:118115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr5:118117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr5:118174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B106,C70,C8
`Chr5:118249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:118269`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	71	A1,A13,A20,A24,B103,B106,B108,B113,B117,B131,B134,B139,B18,B20,B21,B22,B29,B32,B35,B37,B40,B5,B55,B56,B59,B6,B66,B68,B69,B71,B72,B74,B77,B78,B84,B86,B90,B91,B95,C13,C16,C19,C27,C35,C37,C39,C41,C43,C47,C48,C50,C51,C56,C58,C59,C60,C64,C68,C69,C7,C72,C73,C78,C80,C81,C82,C83,C85,D1,D11,D5
`Chr5:118271`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	71	A1,A13,A20,A24,B103,B106,B108,B113,B117,B131,B134,B139,B18,B20,B21,B22,B29,B32,B35,B37,B40,B5,B55,B56,B59,B6,B66,B68,B69,B72,B74,B77,B78,B84,B86,B90,B91,B95,C13,C16,C19,C27,C35,C37,C39,C41,C43,C46,C47,C48,C50,C51,C56,C58,C59,C60,C64,C68,C69,C7,C72,C73,C78,C80,C81,C82,C83,C85,D1,D11,D5
`Chr5:118316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B100,B130,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812369.1

736 aa

368

736

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 204-353 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812369.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	204	353	5.4e-28	98.4	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102325.1
TGTAAAAATGTCAAATTGTCATTATTTATGAGTTAGATTGCTTGCAGCTGTTATAATTTTCAACGCGCTTGATCAACTGCTCAATCTTCATAATTAATCTTCCCTATAATTATTCTTCCACACCTTAATTTGCCTTCAAAATCATCAATACATCCATTTTACCATCGTATCAAAATCATTTACTAAAATTCTTGAATGTTTCTGAGATTGTATCAAAACCAGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTTGACTTGTGCCAACTC...

XR_009102324.1
TAAAAATGTCAAATTGTCATTATTTATGAGTTAGATTGCTTGCAGCTGTTATAATTTTCAACGCGCTTGATCAACTGCTCAATCTTCATAATTAATCTTCCCTATAATTATTCTTCCACACCTTAATTTGCCTTCAAAATCATCAATACATCCATTTTACCATCGTATCAAAATCATTTACTAAAATTCTTGAATGTTTCTGAGATTGTATCAAAACCAGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTTGACTTGTGCCAACTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026510
ATGGCGGCTTATGGTGCGGCGGATTCTCTGAAGAATACGATTGAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTTTCCCACTCTCCACAAATACTACCCTCAGCTGATTATGGTGCAGTGACTTTTCTCAAGAATACGATTCACTGTATTCTACAATTGTTTTGCATTTCCCCCTCTCCACAGATCTTACTACCTGCCTACGACGAGGTGGATCGCTTGCAGAATGTTCTGCTCAAATTGGACGACACCAGCTGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812369.1
MAAYGAADSLKNTIERILQSSRISLVSHSPQILPSADYGAVTFLKNTIHCILQLFCISPSPQILLPAYDEVDRLQNVLLKLDDTSCSKIRTKVNAADELIKEAIWEFEDLLESHVLPQILPQLDSERDNLSFSVELQSLQLHVDCFVEKMKKMEEEYTYEMENMPEEEGEPISSRIDFGGINSKMVGLSHEFRKARDDLLEDKNYSIIGMAGVGKTTLAKHIFEDPSIRSHFEFRAWVRVGRKCESNELLRCVLAQVDPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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