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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000034`

染色体: Chr05 坐标: 159772-162850 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000034`
名称	SmilChr05G000034
描述	TITAN-like protein
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	159772 - 162850 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026518`
GeneID	`131026518`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026518`
原始查询	`LOC131026518`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TITAN-like protein
产物	TITAN-like protein
Arabidopsis	`AT4G24900` (TTL) coiled coil protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828592] identity=45; qcov=0.998; evalue=3.23e-106; confidence=high
Rice	`Os09g0506900` - identity=43.3; qcov=0.44; evalue=1.88e-44; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14968 (CCDC84)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026518

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812377.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812377.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812377.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812377.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057812377.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:160396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,C38,C9
`Chr5:161301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:161320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C20
`Chr5:161390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C12,C54
`Chr5:161444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr5:161535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr5:161645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr5:161700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B110,B130,C24,D6
`Chr5:161709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B110,B130,C24,D6
`Chr5:161995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:162060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C85
`Chr5:162091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812377.1

426 aa

213

426

CCDC84

PF14968 CCDC84 19-392 aa

XP_057812378.1

425 aa

212

425

CCDC84

PF14968 CCDC84 19-391 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812377.1`	Pfam	`PF14968`	CCDC84	Coiled-coil	19	392	2.7e-89	300.8	Coiled coil protein 84
`XP_057812378.1`	Pfam	`PF14968`	CCDC84	Coiled-coil	19	391	7.2e-87	292.9	Coiled coil protein 84

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956394.1
ATACAACTTCGAAAAGAAAAAAACCAAATTCCCAATGCAGAATAAATAGCTTAACTCGAGGCGTAAAATTTAAATTTAGAAGCAAAATCCCAAAAACGCTTAAATCCTTCCACGGCGGAGCTCCGGCGCCGACGACGGCCCGTGGTGGTGCGCGCGGTTTTACCGGGATACTCTTTCGGAAAAGGTGTAAACATCAATTCGCTTCAAAGTTTCACAATCACGAGCCCTAGCTGAGATGAATCACAGCAACAAGAAGAAGA...

XM_057956395.1
ATACAACTTCGAAAAGAAAAAAACCAAATTCCCAATGCAGAATAAATAGCTTAACTCGAGGCGTAAAATTTAAATTTAGAAGCAAAATCCCAAAAACGCTTAAATCCTTCCACGGCGGAGCTCCGGCGCCGACGACGGCCCGTGGTGGTGCGCGCGGTTTTACCGGGATACTCTTTCGGAAAAGGTGTAAACATCAATTCGCTTCAAAGTTTCACAATCACGAGCCCTAGCTGAGATGAATCACAGCAACAAGAAGAAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026518
ATGAATCACAGCAACAAGAAGAAGAAGAGCAGAAACGAACCGCATGAATTCGAGTTCTGCGAGGTCTGTAAATTGAACCACAACCACGGCCGCCGCCACAATTATTTGCCAAGCCACAAAAATTCACTCTCCAGCCTCCTCGCGCGCTTCCAATCGAAGCTCTCCGACGTCAAATTCTTCCTCAAAACTCCGATGCCGATCCTTCCGGAGCTCGCGCACCAGAATCGCCTCTGGTGCGTGTTCTGCAATTGCGACATTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057812377.1
MNHSNKKKKSRNEPHEFEFCEVCKLNHNHGRRHNYLPSHKNSLSSLLARFQSKLSDVKFFLKTPMPILPELAHQNRLWCVFCNCDIVELDSQFACSNAVEHLAGEEHWKRVKGFMWKYGGGMDRVDLFRISEADYAKWEKKCKTLKMEAAKTQSVGTLNDIHNKHNAEFVNSSCNNNFDALNSCIPNYVVPLHSYTDERTPLSSSVLSSSVSNTGPSLYNISGDKDAQYLKNSTGYVDNQHFSNSLTREGSSYDYSSNGS...

XP_057812378.1
MNHSNKKKKSRNEPHEFEFCEVCKLNHNHGRRHNYLPSHKNSLSSLLARFQSKLSDVKFFLKTPMPILPELAHQNRLWCVFCNCDIVELDSQFACNAVEHLAGEEHWKRVKGFMWKYGGGMDRVDLFRISEADYAKWEKKCKTLKMEAAKTQSVGTLNDIHNKHNAEFVNSSCNNNFDALNSCIPNYVVPLHSYTDERTPLSSSVLSSSVSNTGPSLYNISGDKDAQYLKNSTGYVDNQHFSNSLTREGSSYDYSSNGSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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