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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000033`

染色体: Chr05 坐标: 156197-158966 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000033`
名称	SmilChr05G000033
描述	ALA-interacting subunit 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	156197 - 158966 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026520`
GeneID	`131026520`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026520`
原始查询	`LOC131026520`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ALA-interacting subunit 1-like
产物	ALA-interacting subunit 1-like
Arabidopsis	`AT3G12740` (ALIS1) ALA-interacting subunit 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820456] identity=64.8; qcov=0.97; evalue=4.6e-161; confidence=high
Rice	`Os03g0120100` - identity=65.6; qcov=0.967; evalue=3.37e-163; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03381 (CDC50)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026520

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057812382.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057812382.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057812382.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057812382.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057812382.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:156952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr5:157491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:157518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:157573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B111,B113,B114
`Chr5:157626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr5:158319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812382.1

337 aa

168

337

CDC50

PF03381 CDC50 59-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812382.1`	Pfam	`PF03381`	CDC50	Family	59	322	1.4e-87	294.5	LEM3 (ligand-effect modulator 3) family / CDC50 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956399.1
AATCTCGATTTAAATTTAATTTGCAATCTCCCTAAACACAAAGAAAGAAAAAGAATAGGGAGATTCCAAGCACATCATTACACGACTTGATTTCCTTCCTTTCAAAGAAAAGCACAAAATTTAAGGATTTCAGATTATGTTTCTTGTCTGAAAGGGACATCCTTCGGCCTAAAATAATTTTCATTTTTTTTTTAAATTTTTATTCTTTTTTCAAATGAGTTCCGATGATGTATCCTCTCTACCTTCCAAAAAGGTTTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026520
ATGAGTTCCGATGATGTATCCTCTCTACCTTCCAAAAAGGTTTCCAGGAAGCCCATATATTCAAGATTTACTCAGCAAGAACTCCCCGCCTGCAAACCGATTCTTACTCCTGCATTGGTCATTGGAATTCTCATCTGCCTCGCCATAATCTTCATTCCAATCGGTCTGCTCGCTCTTTCCGCATCAGAGAATGTGGTTGAAGTGGTGGACCGTTATGACGACGCGTGCATTCCATCGACGAACCAGAAGGTTGGCTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812382.1
MSSDDVSSLPSKKVSRKPIYSRFTQQELPACKPILTPALVIGILICLAIIFIPIGLLALSASENVVEVVDRYDDACIPSTNQKVGFIKDPATNKTCIRSLTVPKKMRKPIYVYYQLDNFYQNHRRYVKSRSDRQLWSPKSESSTNLCDPEGQTGDGKPIVPCGLIAWSLFNDTYALSKNDAALQINKKDIAWRSDRTHKFGPNVYPKNFQNGPLIGGGKLDENIPLSQQEDLMVWMRTAALPTFRKLYGKIETDLEANER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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