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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000042`

染色体: Chr05 坐标: 202808-205012 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000042`
名称	SmilChr05G000042
描述	transcription factor MYB54-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	202808 - 205012 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026531`
GeneID	`131026531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026531`
原始查询	`LOC131026531`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB54-like
产物	transcription factor MYB54-like
Arabidopsis	`AT1G17950` (MYB52) myb domain protein 52 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838374] identity=51.7; qcov=1.19; evalue=1.08e-76; confidence=high
Rice	`Os03g0720800` (OsMYB52) - identity=46.5; qcov=1.18; evalue=1.37e-61; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812396.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812396.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812396.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812396.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057812396.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:203944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B63,D10
`Chr5:204006`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B90
`Chr5:204006`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B90
`Chr5:204029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B136,B29,C85
`Chr5:204043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:204169`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	B10,B100,B103,B118,B133,B135,B19,B24,B29,B59,B60,B66,B69,B80,B90,B91,B92,C4,C49,C55,C63,C71,C77,C78,C85,C9,D3
`Chr5:204659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B27
`Chr5:204740`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B63
`Chr5:204740`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B63
`Chr5:204840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812396.1

220 aa

110

220

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 5-52 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 8-69 aa PF00249 Myb_DNA-binding 58-100 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 61-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812396.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	5	52	3.3e-35	120.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057812396.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	8	69	3.1e-27	95.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057812396.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	58	100	3.3e-35	120.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057812396.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	61	115	3.1e-27	95.3	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956413.1
GTAAATTAAGAGATTAGTAAGTAGTTTGTTAGCCTAGATGTTGCATCAATGGGTGGTGCTGGTCTGTCCAAATCCTCCCACTTCCTAACGGAAAACAAAACTCTTGTTTATCTAATTAATTATTTCAACTTCTTCAATATTACTCTCTCATACCTCATCTTCTTCCCAACTTCTCTCACTCTCTTTCTTTAGATATACACATGCATGCACACACACACATATATATATATATAGCGCCTCTCACTTCGATCATCAATGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026531
ATGATGTGTAGTAGAGGGCATTGGAGGCCTGCAGAAGATGAGAAGCTAAGAGAATTAGTTGAAAGATATGGACCTCATAACTGGAATGCTATTGCTCAACATCTTCCTGCACCTAGATCAGGAAAAAGTTGCAGGCTGAGATGGTTCAATCAGCTGGATCCAAGAATAAACCGGCGGCCGTTCACGGAGGAGGAGGAGGAGCGCCTCCTCGGCTGCCACCGGATTCACGGGAACCGGTGGGCGATAATCGCCCGACACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812396.1
MMCSRGHWRPAEDEKLRELVERYGPHNWNAIAQHLPAPRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRPFTEEEEERLLGCHRIHGNRWAIIARHFPGRTDNAVKNHWHVIMARKCREKSKFYAKNQSVFLGNNPRFSPLVMELHQSHHKLLHHQERSGKSVEFYDFLQVNTDSNRSSEVIDDDAIRRRDNEEEEVDQQSVYHSINQTNNNSPSSLPFIDFLSLGNNPT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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