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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000048`

染色体: Chr05 坐标: 226007-228415 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000048`
名称	SmilChr05G000048
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	226007 - 228415 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026534`
GeneID	`131026534`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026534`
原始查询	`LOC131026534`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=26.3; qcov=0.99; evalue=1.25e-36; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=27.7; qcov=0.852; evalue=1.3e-41; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026534

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057812401.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057812401.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812401.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812401.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812401.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:226133`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	28	A14,A5,B11,B121,B125,B129,B138,B22,B35,B50,B62,B75,B78,B80,B9,B90,B91,B92,C30,C50,C56,C64,C73,C75,C81,D10,D11,D3
`Chr5:226153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B122,B32,B79,C16
`Chr5:226172`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A1,A10,A4,A8,B102,B110,B118,B119,B121,B131,B17,B23,B25,B30,B31,B33,B36,B45,B55,B57,B60,B65,B95,C22,C28,C29,C39,C47,C49,C50,C52,C64,C66,C74,C84,C86,D4,D8
`Chr5:226340`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A1,A18,A2,A22,A7,B105,B111,B12,B34,B53,B74,B82,B84,B93,B97,C25,C48,C79,C8,D5
`Chr5:226422`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A11,A2,B18,B44,B48,B49,B6,B63,B73,B82,C10,C39,C45,C46,C67,C7,C8
`Chr5:226424`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A11,A2,B18,B44,B48,B49,B6,B63,B73,B82,C10,C39,C45,C46,C67,C7,C8
`Chr5:226485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:226529`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B122
`Chr5:226529`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B122
`Chr5:226538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:226593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C36,C42
`Chr5:226601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,C24,C42,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812401.1

607 aa

304

607

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 159-326 aa

XP_057812403.1

607 aa

304

607

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 159-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812401.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	159	326	3.4e-30	105.6	NB-ARC domain
`XP_057812403.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	159	326	3.4e-30	105.6	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956418.1
GAGGCCCAACCCACTTAGTTCTTTCTCTCTAGTTTTCACCCGCAGCCGCAGCGCCGCATATTCCCTTCTTCATTCATCTTATTCCGACAACCTCGTCACCACCGAACAAAACCCAGCTGCTGCCGCGCCGACTCGCTCCAATCTCCTCTCATAGAGGTACAGTTGAGATCTAAATTTGCCCATAATCGTATTCTCAGATAATCGACCTTGAGAATTTCGCTATGGCGGCTTATGGTGCAGCGACTTCTCTGAAGATTACG...

XM_057956420.1
TCTTTCTCTCTAGTTTTCACCCGCAGCCGCAGCGCCGCATATTCCCTTCTTCATTCATCTTATTCCGACAACCTCGTCACCACCGAACAAAACCCAGCTGCTGCCGCGCCGACTCGCTCCAATCTCCTCTCATAGAGCCCATAATCGTATTCTCAGATAATCGACCTTGAGAATTTCGCTATGGCGGCTTATGGTGCAGCGACTTCTCTGAAGATTACGATTCAGCGTATTCTGCAATCGTCTCGCATTTCCCTTGTTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026534
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCGACTTCTCTGAAGATTACGATTCAGCGTATTCTGCAATCGTCTCGCATTTCCCTTGTTTCCCCCTCTCTGCAAATCTTACTAACCGCCTACGAAGAGATGGATCAATTGCAGAAAGTTCTGCTAAAATTGGATGACACAAGCTGCAGCAAGATCAGGACGAAGGTGAATGCTGCGGATGAACGAATCAAAGAGGCAGTTTGGGAATTTGAAGATTTACTCGAATCCCACGTCTTACATCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057812401.1
MAAYGAATSLKITIQRILQSSRISLVSPSLQILLTAYEEMDQLQKVLLKLDDTSCSKIRTKVNAADERIKEAVWEFEDLLESHVLHHILPQLESERDHLSFSVDLQSLQHRVDSFIEKMKMMEEEYTNEMDNLPEEEGEPVFSRIDFGGIKSKMVGLSDEFEKARDFLLEENNNNNYSIIGMAGIGKTTLAKHIFEDPSIRSHFKFRAWVKVGRKCEYDELLRCILAQVDPNAYQMLTQGDDDEELVGLLKERLKDKKCL...

XP_057812403.1
MAAYGAATSLKITIQRILQSSRISLVSPSLQILLTAYEEMDQLQKVLLKLDDTSCSKIRTKVNAADERIKEAVWEFEDLLESHVLHHILPQLESERDHLSFSVDLQSLQHRVDSFIEKMKMMEEEYTNEMDNLPEEEGEPVFSRIDFGGIKSKMVGLSDEFEKARDFLLEENNNNNYSIIGMAGIGKTTLAKHIFEDPSIRSHFKFRAWVKVGRKCEYDELLRCILAQVDPNAYQMLTQGDDDEELVGLLKERLKDKKCL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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