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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000090`

染色体: Chr05 坐标: 499024-501589 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000090`
名称	SmilChr05G000090
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	499024 - 501589 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026569`
GeneID	`131026569`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026569`
原始查询	`LOC131026569`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
产物	polyphenol oxidase I%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0624500` (Ph=Bhc(Po)) - identity=39.4; qcov=1.02; evalue=5.25e-109; confidence=medium
GO	GO:0004097 (catechol oxidase activity)
KEGG	smil00350 (Tyrosine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00950 (Isoquinoline alkaloid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00264 (Tyrosinase); PF12142 (PPO1_DWL); PF12143 (PPO1_KFDV)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026569

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057812439.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812439.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812439.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812439.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812439.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:499285`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	B123,B140,B19,B2,B35,B41,B44,B54,B72,B86,B91,C10,C14,C16,C21,C22,C28,C34,C4,C49,C53,C54,C59,C74,C75,D4,D9
`Chr5:499319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B41,B44,C10
`Chr5:499401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C55
`Chr5:499404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr5:499408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr5:499441`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	122	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A21,A23,A25,A4,A7,A9,B103,B106,B107,B108,B11,B111,B117,B120,B121,B123,B129,B13,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B139,B15,B16,B18,B19,B2,B21,B23,B24,B3,B32,B33,B37,B38,B39,B40,B44,B45,B46,B54,B55,B56,B59,B60,B61,B63,B67,B69,B70,B71,B72,B74,B75,B77,B79,B8,B81,B82,B83,B85,B86,B87,B88,B91,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C16,C17,C19,C22,C23,C27,C28,C31,C33,C34,C35,C38,C4,C40,C47,C49,C5,C52,C53,C54,C55,C56,C59,C60,C62,C69,C70,C74,C75,C83,C85,C9,D1,D2,D3,D4,D8,D9
`Chr5:499455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr5:499563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C20,C40,D11
`Chr5:499717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B9,C16,C27,C33,D2
`Chr5:499723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr5:499800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr5:499818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812439.1

521 aa

260

521

Tyrosinase

PPO1_DWL

PPO1_KFDV

PF00264 Tyrosinase 103-311 aa PF12142 PPO1_DWL 330-375 aa PF12143 PPO1_KFDV 398-515 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812439.1`	Pfam	`PF00264`	Tyrosinase	Domain	103	311	2e-32	114.0	Common central domain of tyrosinase
`XP_057812439.1`	Pfam	`PF12142`	PPO1_DWL	Domain	330	375	5.1e-18	65.2	Polyphenol oxidase middle domain
`XP_057812439.1`	Pfam	`PF12143`	PPO1_KFDV	Domain	398	515	5.8e-29	101.5	Chloroplastic Polyphenol Oxidase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956456.1
TTCATTCAACGCGATCGCCACCACCACCAACTCCCCATTTCAAAAGCCCTCCCAGCTGGGCAGCAGGCGGAGGCACCGCTTCGACGCGTCGTGCAGCAGCGGTGGCGGCCGTGTAGACCGCAGAAACATGCTGCTTGGACTGGGTGGTCTATACGGCCTCATCCGCAATGCTGAGGCGCTTCCGATTGCGCCTCCCGACGTGAGCAAGTGCGAGCCCGGAGGCGCCTATACATTTAGAAACGGAGAGGTAATATCTCTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026569
ATGCTGCTTGGACTGGGTGGTCTATACGGCCTCATCCGCAATGCTGAGGCGCTTCCGATTGCGCCTCCCGACGTGAGCAAGTGCGAGCCCGGAGGCGCCTATACATTTAGAAACGGAGAGGTAATATCTCTAGACGTCAACTGCTGCCCGCCCTACGCCGACGTTCAGAGCGACTACAAGCTTCCGACGTTTACTAAGCCTCGCATTAGGCCGGCGGCGCACAGGCTGACACCGGAATACATAGCCAAGTACGAGAGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812439.1
MLLGLGGLYGLIRNAEALPIAPPDVSKCEPGGAYTFRNGEVISLDVNCCPPYADVQSDYKLPTFTKPRIRPAAHRLTPEYIAKYERAIQKMKDLDVTDPDDPRGFTQQANVHCAYCNGPYDQVNHEGIDIQVHNSWVFFPFHRWYLYFFERIMGELIEDPDFALPYWNWDNPRGMQMPSMFDRDASPLYDLNRDQMHRPPAVVALALTNPPITNPVQIISNNLTQMYKEMIGDVESPIDFMGNPYSDGDYPPEATEGGLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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