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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000094`

染色体: Chr05 坐标: 542378-548997 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000094`
名称	SmilChr05G000094
描述	lectin-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	542378 - 548997 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026572`
GeneID	`131026572`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026572`
原始查询	`LOC131026572`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lectin-like
产物	lectin-like
Arabidopsis	`AT5G10530` (AT5G10530) Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830918] identity=30.6; qcov=0.996; evalue=1.2e-15; confidence=low
Rice	`Os09g0334800` - identity=37.2; qcov=0.75; evalue=2.35e-29; confidence=medium
GO	GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00139 (Lectin_legB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026572

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057812442.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057812442.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812442.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812442.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812442.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:547837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:547919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr5:547936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B66,C65
`Chr5:547949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr5:547958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C73
`Chr5:547959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,A19,C85,D8
`Chr5:547961`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A23,A5,B12,B135,B15,B18,B19,B49,B66,B97,C28,C34,C52,C68,C73,D4,D9
`Chr5:547966`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A23,A5,B12,B135,B15,B18,B19,B49,B66,B97,C28,C34,C38,C52,C68,C73,D4,D9
`Chr5:548006`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	123	A1,A14,A16,A18,A20,A23,A24,A25,A3,A5,A9,B1,B10,B102,B103,B107,B110,B113,B12,B121,B123,B124,B127,B128,B13,B130,B133,B134,B139,B14,B140,B15,B20,B22,B24,B26,B28,B30,B31,B33,B35,B37,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B53,B55,B56,B6,B60,B63,B65,B68,B71,B75,B76,B78,B8,B80,B84,B85,B88,B89,B93,B96,B99,C10,C13,C15,C16,C17,C2,C21,C22,C24,C26,C28,C3,C30,C34,C35,C42,C43,C44,C46,C49,C5,C50,C51,C54,C55,C56,C58,C59,C60,C61,C67,C7,C70,C72,C74,C76,C77,C79,C8,C80,C82,C83,C86,C87,D1,D2,D4,D6,D9
`Chr5:548008`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A15,A19,C70
`Chr5:548008`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A15,A19,C70
`Chr5:548056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812442.1

276 aa

138

276

Lectin_legB

PF00139 Lectin_legB 50-263 aa

XP_057812443.1

276 aa

138

276

Lectin_legB

PF00139 Lectin_legB 50-263 aa

XP_057812444.1

276 aa

138

276

Lectin_legB

PF00139 Lectin_legB 50-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812442.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	50	263	1.2e-41	143.6	Legume lectin domain
`XP_057812443.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	50	263	1.2e-41	143.6	Legume lectin domain
`XP_057812444.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	50	263	1.2e-41	143.6	Legume lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956461.1
CTCGAGCAGCAGGTGACGGCGAGGATCAACTACGCCGCCTCCACAAAGTTGATCGCCGTCCGTGCCACCGCCGGCTCGAAGACGTTTGAAGTCAGCTATGAGTATGATTTGAGCGGCTTTCTTCCTTAGCAGGTTCAGTGAATCAGTAATTACATTTGGAAGGATCCTATGCAACTACATAATTCTGGCACAGCCAGTACCTTGTCGTCTCCGCTGCCGCCAAGGGCCGCCCACTGCCCTCTGTCACTGTCTACTGGCAT...

XM_057956460.1
CGTCCGTGCCACCGCCGGCTCGAAGACGTTTGAAGTCAGCTATGAGTATGATTTGAGCGGCTTTCTTCCTTAGCAGGTTCAGGTAGGGCTCTCCGCCGCCACCAGACTAGACGGACCCACCACCCATGATATCGTCTCATGTGAATCAGTAATTACATTTGGAAGGATCCTATGCAACTACATAATTCTGGCACAGCCAGTACCTTGTCGTCTCCGCTGCCGCCAAGGGCCGCCCACTGCCCTCTGTCACTGTCTACTGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131026572
ATGGCTTCTTCCTTCCCCCAAACCCTAATTCCTCTTGTTTGTTCCATCACCTTCCTCCTCGCCCTGGCAACCACGCCGGGCGATGCGACCTCCCGCACTGGCCACACGTCCTCCTTCAACCAAAAGCCGCCGCCTTTGAACACCGAAATCCTGGAAGGCGACGCCCACTACGTCACTGACAACAACGGGGTTGACTTCATCCGCCTGACGAAAACCGACGAGTCGGGCAAGGCGCTCCAGTACAGTGCCGGGCGAGCCTA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057812442.1
MASSFPQTLIPLVCSITFLLALATTPGDATSRTGHTSSFNQKPPPLNTEILEGDAHYVTDNNGVDFIRLTKTDESGKALQYSAGRAYYGKPLNFWGEGMQIDFEATMKFKINPNSGDNDPADGFCFFIEPLEAPMGASGGSFGVFDSSGKKDSTFAVEFDPYINTNDPNYRHVGIDIESTDSVVTMKLGDELIGNVVTAKIKYTAATTMINVKVTIGSKNYEMSCLKDLSTVLPQVVKYGFSAATGGQVAVHDLISWQFT...

XP_057812443.1
MASSFPQTLIPLVCSITFLLALATTPGDATSRTGHTSSFNQKPPPLNTEILEGDAHYVTDNNGVDFIRLTKTDESGKALQYSAGRAYYGKPLNFWGEGMQIDFEATMKFKINPNSGDNDPADGFCFFIEPLEAPMGASGGSFGVFDSSGKKDSTFAVEFDPYINTNDPNYRHVGIDIESTDSVVTMKLGDELIGNVVTAKIKYTAATTMINVKVTIGSKNYEMSCLKDLSTVLPQVVKYGFSAATGGQVAVHDLISWQFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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